RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615007.4

LYNX1-208, Transcript of Ly6/neurotoxin 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LYNX1, Length 1,293 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LYNX1-208	ENST00000615007	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		33.23	■■■□□ 2.91
LYNX1-208	ENST00000615007	PI16	Q6UXB8	463 aa		33.23	■■■□□ 2.91
LYNX1-208	ENST00000615007	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		33.23	■■■□□ 2.91
LYNX1-208	ENST00000615007	EFCC1	Q9HA90	598 aa		33.23	■■■□□ 2.91
LYNX1-208	ENST00000615007	RAI14	Q9P0K7	980 aa		33.23	■■■□□ 2.91
LYNX1-208	ENST00000615007	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		33.23	■■■□□ 2.91
LYNX1-208	ENST00000615007	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		33.22	■■■□□ 2.91
LYNX1-208	ENST00000615007	MS4A1	P11836	297 aa		33.22	■■■□□ 2.91
LYNX1-208	ENST00000615007	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
LYNX1-208	ENST00000615007	BTBD19	C9JJ37	291 aa		33.21	■■■□□ 2.91
LYNX1-208	ENST00000615007	PICALM	Q13492	652 aa		33.21	■■■□□ 2.91
LYNX1-208	ENST00000615007	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	33.21	■■■□□ 2.91
LYNX1-208	ENST00000615007	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		33.21	■■■□□ 2.91
LYNX1-208	ENST00000615007	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	33.21	■■■□□ 2.91
LYNX1-208	ENST00000615007	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	33.2	■■■□□ 2.91
LYNX1-208	ENST00000615007	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		33.2	■■■□□ 2.91
LYNX1-208	ENST00000615007	TLR2	O60603	784 aa		33.19	■■■□□ 2.9
LYNX1-208	ENST00000615007	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		33.19	■■■□□ 2.9
LYNX1-208	ENST00000615007	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
LYNX1-208	ENST00000615007	PICK1	Q9NRD5	415 aa		33.19	■■■□□ 2.9
LYNX1-208	ENST00000615007	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		33.19	■■■□□ 2.9
LYNX1-208	ENST00000615007	DOCK1	Q14185	1865 aa		33.18	■■■□□ 2.9
LYNX1-208	ENST00000615007	RHBDL3	P58872	404 aa		33.18	■■■□□ 2.9
LYNX1-208	ENST00000615007	ZNF384	Q8TF68	577 aa		33.18	■■■□□ 2.9
LYNX1-208	ENST00000615007	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		33.18	■■■□□ 2.9
LYNX1-208	ENST00000615007	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
LYNX1-208	ENST00000615007	IGSF3	O75054	1194 aa		33.17	■■■□□ 2.9
LYNX1-208	ENST00000615007	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		33.17	■■■□□ 2.9
LYNX1-208	ENST00000615007	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		33.17	■■■□□ 2.9
LYNX1-208	ENST00000615007	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
LYNX1-208	ENST00000615007	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
LYNX1-208	ENST00000615007	MAP3K10	Q02779	954 aa		33.16	■■■□□ 2.9
LYNX1-208	ENST00000615007	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		33.16	■■■□□ 2.9
LYNX1-208	ENST00000615007	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
LYNX1-208	ENST00000615007	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		33.15	■■■□□ 2.9
LYNX1-208	ENST00000615007	KIF22	Q14807	665 aa		33.15	■■■□□ 2.9
LYNX1-208	ENST00000615007	CEP85	Q6P2H3	762 aa		33.15	■■■□□ 2.9
LYNX1-208	ENST00000615007	CXCL11	O14625	94 aa		33.14	■■■□□ 2.9
LYNX1-208	ENST00000615007	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		33.13	■■■□□ 2.89
LYNX1-208	ENST00000615007	PANK1	Q8TE04	598 aa		33.13	■■■□□ 2.89
LYNX1-208	ENST00000615007	SNRK	Q9NRH2	765 aa		33.13	■■■□□ 2.89
LYNX1-208	ENST00000615007	TBC1D12	O60347	775 aa		33.12	■■■□□ 2.89
LYNX1-208	ENST00000615007	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
LYNX1-208	ENST00000615007	BAG3	O95817	575 aa		33.12	■■■□□ 2.89
LYNX1-208	ENST00000615007	PLCG2	P16885	1265 aa		33.12	■■■□□ 2.89
LYNX1-208	ENST00000615007	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	33.12	■■■□□ 2.89
LYNX1-208	ENST00000615007	PDHX	O00330	501 aa		33.11	■■■□□ 2.89
LYNX1-208	ENST00000615007	TEX11	Q8IYF3	940 aa		33.11	■■■□□ 2.89
LYNX1-208	ENST00000615007	PTPRA	P18433	802 aa		33.1	■■■□□ 2.89
LYNX1-208	ENST00000615007	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		33.1	■■■□□ 2.89
LYNX1-208	ENST00000615007	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
LYNX1-208	ENST00000615007	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
LYNX1-208	ENST00000615007	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		33.1	■■■□□ 2.89
LYNX1-208	ENST00000615007	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
LYNX1-208	ENST00000615007	GNRH1	P01148	92 aa		33.09	■■■□□ 2.89
LYNX1-208	ENST00000615007	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
LYNX1-208	ENST00000615007	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
LYNX1-208	ENST00000615007	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	33.09	■■■□□ 2.89
LYNX1-208	ENST00000615007	PTPRF	P10586	1907 aa		33.08	■■■□□ 2.89
LYNX1-208	ENST00000615007	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		33.08	■■■□□ 2.89
LYNX1-208	ENST00000615007	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	33.08	■■■□□ 2.89
LYNX1-208	ENST00000615007	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
LYNX1-208	ENST00000615007	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
LYNX1-208	ENST00000615007	ARMC5	Q96C12	935 aa		33.07	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		33.07	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		33.07	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		33.07	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	33.06	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	ZAP70	P43403	619 aa		33.06	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	CAP1	Q01518	475 aa		33.06	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	MOGS	Q13724	837 aa		33.06	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	C17orf99	Q6UX52	265 aa		33.06	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	33.06	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	33.06	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	33.06	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	33.06	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		33.06	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		33.06	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		33.05	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	NBPF11	Q86T75	865 aa		33.05	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		33.05	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	PRMT2	P55345	433 aa		33.04	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	PPP4C	P60510	307 aa		33.04	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	HTT	P42858	3142 aa		33.03	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		33.03	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	HMMR	O75330	724 aa		33.03	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		33.03	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	CPA4	Q9UI42	421 aa		33.03	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		33.02	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		33.02	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	AACS	Q86V21	672 aa		33.02	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	CERS3	Q8IU89	383 aa		33.02	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	33.02	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		33.02	■■■□□ 2.88
LYNX1-208	ENST00000615007	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		33.02	■■■□□ 2.88

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