RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611415.4

TNS1-220, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-220ENST00000611415 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 KIFAP3Q92845 792 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 KDM2BQ8NHM5 1336 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 MAP3K9P80192 1104 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 SIRT1Q96EB6 747 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 PHACTR3Q96KR7 559 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 B4E1Z4 1266 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 PAK1Q13153 545 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 POTEDQ86YR6 584 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 ACSBG1Q96GR2 724 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 CALUO43852 315 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 KRT5P13647 590 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 CSRNP2Q9H175 543 aa13.39□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 RIMS2Q9UQ26 1411 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 A6NNZ2 444 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 LDHBP07195 334 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 NAA25Q14CX7 972 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 TUBB8Q3ZCM7 444 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 NOX5Q96PH1 765 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 ANKRD2Q9GZV1 360 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 TNNI3KQ59H18 835 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP13.38□□□□□ -0.272e-6■■■■□ 23.8
TNS1-220ENST00000611415 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 ABCC10Q5T3U5 1492 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 RNMTO43148 476 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 FYB2Q5VWT5 728 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 MLKLQ8NB16 471 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa13.38□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 NDUFAB1O14561 156 aa13.37□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 SAMD9Q5K651 1589 aa13.37□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 SPOPO43791 374 aa13.37□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 CEP85LQ5SZL2 805 aa13.37□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 A2MP01023 1474 aa13.37□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 A0A1W2PP64 1363 aa13.37□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 INPP5BP32019 993 aa13.37□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 GBP1P32455 592 aa13.37□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 CCDC110Q8TBZ0 833 aa13.37□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 ZNF202O95125 648 aa13.37□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 CADPS2Q86UW7 1296 aa13.37□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa13.37□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 LMBRD1Q9NUN5 540 aa13.37□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa13.37□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 WDR44Q5JSH3 913 aa13.36□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 TMTC1Q8IUR5 882 aa13.36□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 UBL4BQ8N7F7 174 aa13.36□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 CARD14Q9BXL6 1004 aa13.36□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 DENND2AQ9ULE3 1009 aa13.36□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 G2E3Q7L622 706 aa13.36□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 INF2Q27J81 1249 aa13.36□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 TESK2Q96S53 571 aa13.35□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 EYA1Q99502 592 aa13.35□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa13.35□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 GOLGA6BA6NDN3 693 aa13.35□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 B4DLN1 442 aa13.35□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 ARHGAP6O43182 974 aa13.35□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 ODF2LQ9ULJ1 636 aa13.35□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 TTC38Q5R3I4 469 aa13.35□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 OGFOD1Q8N543 542 aa13.35□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa13.35□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 SGSM2O43147 1006 aa13.35□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 OAS2P29728 719 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 FAM227BQ96M60 508 aa13.35□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 ARMT1Q9H993 441 aa13.35□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa13.35□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 POSTNQ15063 836 aa13.35□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 CDC37L1Q7L3B6 337 aa13.35□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 IL2RBP14784 551 aa13.34□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa13.34□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 DCAF5Q96JK2 942 aa13.34□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 LMNTD2Q8IXW0 634 aa13.34□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 RUFY4Q6ZNE9 571 aa13.34□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 TAOK1Q7L7X3 1001 aa13.34□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 A0A1B0GUA9 196 aa13.34□□□□□ -0.27
TNS1-220ENST00000611415 HOXC9P31274 260 aa13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms