RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 ITGA6P23229 1130 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF165P49910 485 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 SEPT6Q14141 434 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 MPP2Q14168 576 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 PKDCCQ504Y2 493 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 C16orf86Q6ZW13 317 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 OR6P1Q8NGX9 317 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 STK35Q8TDR2 534 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 GMCL1Q96IK5 515 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 BRMS1Q9HCU9 246 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 LEMD3Q9Y2U8 911 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 CROCC2H7BZ55 1655 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 ABCA8O94911 1581 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 CILPO75339 1184 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM37O94972 964 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 MASP1P48740 699 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 CLCQ05315 142 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 FXNQ16595 210 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF423Q2M1K9 1284 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 TKFCQ3LXA3 575 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 GK5Q6ZS86 529 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 HFE2Q6ZVN8 426 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 VN1R5Q7Z5H4 357 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM39AQ9NV64 488 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 KLF15Q9UIH9 416 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNRF3Q9ULT6 936 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPNS1-210ENST00000590211 SHROOM2Q13796 1616 aa5.64□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 KIF14Q15058 1648 aa5.64□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 LMNB1P20700 586 aa5.64□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 CASP7P55210 303 aa5.64□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 C2orf27AQ580R0 203 aa5.64□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC181Q5TID7 509 aa5.64□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 REC114Q7Z4M0 266 aa5.64□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 JMYQ8N9B5 988 aa5.64□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 ASAP3Q8TDY4 903 aa5.64□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 FEZ1Q99689 392 aa5.64□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC52A1Q9NWF4 448 aa5.64□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 CHPF2Q9P2E5 772 aa5.64□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 SOX13Q9UN79 622 aa5.64□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 UACAQ9BZF9 1416 aa5.64□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa5.63□□□□□ -1.51
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CAPNS1-210ENST00000590211 IMPDH2P12268 514 aa5.63□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 SELPP16109 830 aa5.63□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 MTERF2Q49AM1 385 aa5.63□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 SPATC1Q76KD6 591 aa5.63□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 CERS3Q8IU89 383 aa5.63□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 GAL3ST3Q96A11 431 aa5.63□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 ADAM19Q9H013 955 aa5.63□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa5.63□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 NAGPAQ9UK23 515 aa5.63□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 CYP8B1Q9UNU6 501 aa5.63□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 KDM2BQ8NHM5 1336 aa5.63□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 NAIPQ13075 1403 aa5.63□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 SIN3BO75182 1162 aa5.62□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 B3GALT4O96024 378 aa5.62□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 NME2P22392 152 aa5.62□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP2R3AQ06190 1150 aa5.62□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa5.62□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP2R5EQ16537 467 aa5.62□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 RUFY4Q6ZNE9 571 aa5.62□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 SYT9Q86SS6 491 aa5.62□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 PDZD3Q86UT5 571 aa5.62□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa5.62□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 BSNDQ8WZ55 320 aa5.62□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 TNFRSF25Q93038 417 aa5.62□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM47Q96LD4 638 aa5.62□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 EHMT1Q9H9B1 1298 aa5.62□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 PFDN2Q9UHV9 154 aa5.62□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 SAMM50Q9Y512 469 aa5.62□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 PTPRKQ15262 1439 aa5.62□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa5.62□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 PLB1Q6P1J6 1458 aa5.62□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 B2RBV5 119 aa5.61□□□□□ -1.51
CAPNS1-210ENST00000590211 GPR25O00155 361 aa5.61□□□□□ -1.51
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