RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560359.1

GABPB1-AS1-204, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene GABPB1-AS1, Length 709 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CST9Q5W186 159 aa28.88■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CDAN1Q8IWY9 1227 aa28.88■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MYH1P12882 1939 aa28.88■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FLT1P17948 1338 aa28.88■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa28.88■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TMEM88BA6NKF7 163 aa28.87■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 USP5P45974 858 aa28.87■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa28.87■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZFPM1Q8IX07 1006 aa28.87■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 M0R2C6 588 aa28.86■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HSPA6P17066 643 aa28.85■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ATRNL1Q5VV63 1379 aa28.85■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HIP1O00291 1037 aa28.84■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa28.84■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HOOK2Q96ED9 719 aa28.84■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HELLSQ9NRZ9 838 aa28.84■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GPAA1O43292 621 aa28.83■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CREBZFQ9NS37 354 aa28.83■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FKBP1BP68106 108 aa28.82■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BMP2KLQ5H9B9 411 aa28.82■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C2orf69Q8N8R5 385 aa28.82■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SDR42E1Q8WUS8 393 aa28.82■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FAM227BQ96M60 508 aa28.82■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CSRNP1Q96S65 589 aa28.82■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa28.82■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa28.82■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SIPA1L1O43166 1804 aa28.81■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 A0A0D9SFI3 127 aa28.81■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PRKAB2O43741 272 aa28.81■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa28.8■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GNAT2P19087 354 aa28.79■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PRKG1Q13976 671 aa28.79■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa28.79■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DCAF15Q66K64 600 aa28.79■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TLL2Q9Y6L7 1015 aa28.79■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 OTOFQ9HC10 1997 aa28.79■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa28.78■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ARMC9Q7Z3E5 817 aa28.78■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MAP3K11Q16584 847 aa28.77■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MOB2Q70IA6 237 aa28.77■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SAPCD2Q86UD0 394 aa28.77■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PALD1Q9ULE6 856 aa28.77■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FZD1Q9UP38 647 aa28.77■■■□□ 2.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 USP2O75604 605 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DDRGK1Q96HY6 314 aa28.76■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MCM9Q9NXL9 1143 aa28.76■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GSG1L2A8MUP6 293 aa28.75■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HLA-DOAP06340 250 aa28.75■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CHMLP26374 656 aa28.75■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 IREB2P48200 963 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MIGA2Q7L4E1 593 aa28.75■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF341Q9BYN7 854 aa28.75■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PI4KBQ9UBF8 816 aa28.75■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CCDC171Q6TFL3 1326 aa28.74■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HUNKP57058 714 aa28.74■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HTRA3P83110 453 aa28.74■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GIMAP6Q6P9H5 292 aa28.74■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LAMB1P07942 1786 aa28.74■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 UBE2Q2LH0YL09 131 aa28.73■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MAP3K10Q02779 954 aa28.73■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa28.73■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TTC6Q86TZ1 520 aa28.73■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28.73■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TBC1D12O60347 775 aa28.72■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KLRG1Q96E93 195 aa28.72■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RAD50Q92878 1312 aa28.71■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 APPP05067 770 aa28.71■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LDLRAD1Q5T700 205 aa28.71■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP28.71■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RUFY2Q8WXA3 655 aa28.71■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HHIPL1Q96JK4 782 aa28.71■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NACAP1Q9BZK3 213 aa28.71■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EHD4Q9H223 541 aa28.71■■■□□ 2.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RASSF10A6NK89 507 aa28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms