RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552897.5

TPCN1-222, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 4

Gene TPCN1, Length 596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-222	ENST00000552897	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		29.35	■■■□□ 2.29
TPCN1-222	ENST00000552897	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	29.34	■■■□□ 2.29
TPCN1-222	ENST00000552897	NUCB1	Q02818	461 aa		29.34	■■■□□ 2.29
TPCN1-222	ENST00000552897	CCDC102A	Q96A19	550 aa		29.34	■■■□□ 2.29
TPCN1-222	ENST00000552897	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	29.34	■■■□□ 2.29
TPCN1-222	ENST00000552897	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	29.33	■■■□□ 2.29
TPCN1-222	ENST00000552897	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	29.33	■■■□□ 2.29
TPCN1-222	ENST00000552897	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		29.32	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	ADD2	P35612	726 aa		29.32	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	29.32	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		29.32	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	29.32	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		29.32	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	29.32	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	STAP2	Q9UGK3	403 aa		29.32	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		29.31	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	PLCG2	P16885	1265 aa		29.31	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	MAP2K2	P36507	400 aa		29.31	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	29.31	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	29.31	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	29.3	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	PDE1A	P54750	535 aa		29.3	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	NOG	Q13253	232 aa		29.3	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		29.3	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	29.3	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	CSRNP1	Q96S65	589 aa		29.3	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	ERC2	O15083	957 aa		29.29	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	MAP3K9	P80192	1104 aa		29.29	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	29.29	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		29.29	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		29.29	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	AK9	Q5TCS8	1911 aa		29.29	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		29.28	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	29.28	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		29.28	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	HOOK2	Q96ED9	719 aa		29.28	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	WBP1L	Q9NX94	342 aa		29.28	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	FLT1	P17948	1338 aa		29.27	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	OTOF	Q9HC10	1997 aa		29.27	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	UNCX	A6NJT0	531 aa		29.27	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	29.27	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	29.27	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	VGLL4	Q14135	290 aa		29.27	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	DCAF15	Q66K64	600 aa		29.27	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	WRNIP1	Q96S55	665 aa		29.27	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		29.27	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	29.27	■■■□□ 2.28	1e-6	■■■■■ 31.1
TPCN1-222	ENST00000552897	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		29.27	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		29.27	■■■□□ 2.28
TPCN1-222	ENST00000552897	INPP5B	P32019	993 aa		29.26	■■■□□ 2.27
TPCN1-222	ENST00000552897	GJA5	P36382	358 aa		29.26	■■■□□ 2.27
TPCN1-222	ENST00000552897	MAP3K10	Q02779	954 aa		29.26	■■■□□ 2.27
TPCN1-222	ENST00000552897	UBE3C	Q15386	1083 aa		29.26	■■■□□ 2.27
TPCN1-222	ENST00000552897	SPRYD7	Q5W111	196 aa		29.26	■■■□□ 2.27
TPCN1-222	ENST00000552897	LCORL	Q8N3X6	602 aa		29.26	■■■□□ 2.27
TPCN1-222	ENST00000552897	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		29.26	■■■□□ 2.27
TPCN1-222	ENST00000552897	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	29.26	■■■□□ 2.27
TPCN1-222	ENST00000552897	ELP3	Q9H9T3	547 aa		29.26	■■■□□ 2.27
TPCN1-222	ENST00000552897	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		29.25	■■■□□ 2.27
TPCN1-222	ENST00000552897	WNK4	Q96J92	1243 aa		29.25	■■■□□ 2.27
TPCN1-222	ENST00000552897	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		29.24	■■■□□ 2.27
TPCN1-222	ENST00000552897	ARMT1	Q9H993	441 aa		29.24	■■■□□ 2.27
TPCN1-222	ENST00000552897	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	29.24	■■■□□ 2.27
TPCN1-222	ENST00000552897	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		29.24	■■■□□ 2.27
TPCN1-222	ENST00000552897	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	29.23	■■■□□ 2.27
TPCN1-222	ENST00000552897	FAM196B	A6NMK8	535 aa		29.23	■■■□□ 2.27
TPCN1-222	ENST00000552897	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	29.23	■■■□□ 2.27
TPCN1-222	ENST00000552897	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	29.23	■■■□□ 2.27
TPCN1-222	ENST00000552897	PALD1	Q9ULE6	856 aa		29.23	■■■□□ 2.27
TPCN1-222	ENST00000552897	MBD4	O95243	580 aa		29.22	■■■□□ 2.27
TPCN1-222	ENST00000552897	PDE4A	P27815	886 aa		29.22	■■■□□ 2.27
TPCN1-222	ENST00000552897	USP5	P45974	858 aa		29.22	■■■□□ 2.27
TPCN1-222	ENST00000552897	CERS3	Q8IU89	383 aa		29.22	■■■□□ 2.27
TPCN1-222	ENST00000552897	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		29.22	■■■□□ 2.27
TPCN1-222	ENST00000552897	PRKAB2	O43741	272 aa		29.21	■■■□□ 2.27
TPCN1-222	ENST00000552897	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		29.21	■■■□□ 2.27
TPCN1-222	ENST00000552897	CSAD	Q9Y600	493 aa		29.21	■■■□□ 2.27
TPCN1-222	ENST00000552897	MYH7	P12883	1935 aa		29.21	■■■□□ 2.27
TPCN1-222	ENST00000552897	FOXN1	O15353	648 aa		29.2	■■■□□ 2.26
TPCN1-222	ENST00000552897	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	29.2	■■■□□ 2.26
TPCN1-222	ENST00000552897	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		29.2	■■■□□ 2.26
TPCN1-222	ENST00000552897	OSBP2	Q969R2	916 aa		29.2	■■■□□ 2.26
TPCN1-222	ENST00000552897	OPTN	Q96CV9	577 aa		29.2	■■■□□ 2.26
TPCN1-222	ENST00000552897	TBC1D12	O60347	775 aa		29.19	■■■□□ 2.26
TPCN1-222	ENST00000552897	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		29.19	■■■□□ 2.26
TPCN1-222	ENST00000552897	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	29.19	■■■□□ 2.26
TPCN1-222	ENST00000552897	SIPA1L1	O43166	1804 aa		29.18	■■■□□ 2.26
TPCN1-222	ENST00000552897	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
TPCN1-222	ENST00000552897	FSD1	Q9BTV5	496 aa		29.18	■■■□□ 2.26
TPCN1-222	ENST00000552897	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
TPCN1-222	ENST00000552897	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		29.18	■■■□□ 2.26
TPCN1-222	ENST00000552897	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		29.18	■■■□□ 2.26
TPCN1-222	ENST00000552897	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	29.17	■■■□□ 2.26
TPCN1-222	ENST00000552897	DNAJC18	Q9H819	358 aa		29.17	■■■□□ 2.26
TPCN1-222	ENST00000552897	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	29.17	■■■□□ 2.26
TPCN1-222	ENST00000552897	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		29.16	■■■□□ 2.26
TPCN1-222	ENST00000552897	EVX2	Q03828	476 aa		29.16	■■■□□ 2.26
TPCN1-222	ENST00000552897	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
TPCN1-222	ENST00000552897	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
TPCN1-222	ENST00000552897	APPBP2	Q92624	585 aa		29.16	■■■□□ 2.26

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