RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FKBP1CQ5VVH2 108 aa12.99□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa12.99□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM151AQ8WW52 585 aa12.99□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GJD2Q9UKL4 321 aa12.99□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTPRAP18433 802 aa12.98□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NFIAQ12857 509 aa12.98□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM110CQ1W6H9 321 aa12.98□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TREML2Q5T2D2 321 aa12.98□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 G2E3Q7L622 706 aa12.98□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SCYL3Q8IZE3 742 aa12.98□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa12.98□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLURP2P0DP57 97 aa12.97□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FOXO4P98177 505 aa12.97□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GRIN2CQ14957 1233 aa12.97□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC57Q2TAC2 916 aa12.97□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZFPM1Q8IX07 1006 aa12.97□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa12.97□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AK9Q5TCS8 1911 aa12.96□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBE4AQ14139 1066 aa12.96□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa12.96□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LHX8Q68G74 356 aa12.96□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LMBR1LQ6UX01 489 aa12.96□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TSPYL6Q8N831 410 aa12.96□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa12.96□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MYH16Q9H6N6 1097 aa12.96□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa12.96□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa12.96□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PHF20L1A8MW92 1017 aa12.95□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PEX10O60683 326 aa12.95□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF853P0CG23 659 aa12.95□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PDE3AQ14432 1141 aa12.95□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa12.95□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BADQ92934 168 aa12.95□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RUNDC1Q96C34 613 aa12.95□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STK31Q9BXU1 1019 aa12.95□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PNMA3Q9UL41 463 aa12.95□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1B0GUL6 1792 aa12.94□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCL14Q16627 93 aa12.94□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EPHA10Q5JZY3 1008 aa12.94□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IL27Q8NEV9 243 aa12.94□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ASB2Q96Q27 587 aa12.94□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM198AQ9UFP1 575 aa12.94□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC4A2P04920 1241 aa12.93□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RTP1P59025 263 aa12.93□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GNAI1P63096 354 aa12.93□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DIXDC1Q155Q3 683 aa12.93□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CAVIN4Q5BKX8 364 aa12.93□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HHIPL2Q6UWX4 724 aa12.93□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FBXO33Q7Z6M2 555 aa12.93□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NUDT12Q9BQG2 462 aa12.93□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRIQ9BWK5 157 aa12.93□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 USP40Q9NVE5 1235 aa12.93□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IFT57Q9NWB7 429 aa12.93□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 XIRP2A4UGR9 3374 aa12.92□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAST3O60307 1309 aa12.92□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 THEGQ9P2T0 379 aa12.92□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa12.92□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NCOR1O75376 2440 aa12.92□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CNGA1P29973 690 aa12.91□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPP2Q13103 211 aa12.91□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POTEEQ6S8J3 1075 aa12.91□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINS1Q8NG48 757 aa12.91□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNAAF4Q8WXU2 420 aa12.91□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa12.91□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa12.91□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HMGCS2P54868 508 aa12.9□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHMP4AQ9BY43 222 aa12.9□□□□□ -0.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa12.89□□□□□ -0.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNAJB2P25686 324 aa12.89□□□□□ -0.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RGS3P49796 1198 aa12.89□□□□□ -0.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FLIIQ13045 1269 aa12.89□□□□□ -0.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP12.89□□□□□ -0.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa12.89□□□□□ -0.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.3 ms