RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PSPC1-204ENST00000492741 CACNB3P54284 484 aa26.17■■□□□ 1.78
PSPC1-204ENST00000492741 CTDSPL2Q05D32 466 aa26.17■■□□□ 1.78
PSPC1-204ENST00000492741 PPARAQ07869 468 aa26.17■■□□□ 1.78
PSPC1-204ENST00000492741 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa26.17■■□□□ 1.78
PSPC1-204ENST00000492741 ADCK5Q3MIX3 580 aa26.17■■□□□ 1.78
PSPC1-204ENST00000492741 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
PSPC1-204ENST00000492741 STK11IPQ8N1F8 1099 aa26.17■■□□□ 1.78
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PSPC1-204ENST00000492741 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa26.16■■□□□ 1.78
PSPC1-204ENST00000492741 CLRN2A0PK11 232 aa26.16■■□□□ 1.78
PSPC1-204ENST00000492741 E7EWF7 191 aa26.16■■□□□ 1.78
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PSPC1-204ENST00000492741 TRDNQ13061 729 aa26.14■■□□□ 1.78
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PSPC1-204ENST00000492741 TM6SF1Q9BZW5 370 aa26.14■■□□□ 1.77
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PSPC1-204ENST00000492741 EGFRP00533 1210 aa26.12■■□□□ 1.77
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PSPC1-204ENST00000492741 C12orf60Q5U649 245 aa26.12■■□□□ 1.77
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PSPC1-204ENST00000492741 GLTPD2A6NH11 291 aa26.1■■□□□ 1.77
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PSPC1-204ENST00000492741 TRPM4Q8TD43 1214 aa26.08■■□□□ 1.76
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PSPC1-204ENST00000492741 B4E1Z4 1266 aa26.06■■□□□ 1.76
PSPC1-204ENST00000492741 TNNI2P48788 182 aa26.06■■□□□ 1.76
PSPC1-204ENST00000492741 FKBP1CQ5VVH2 108 aa26.06■■□□□ 1.76
PSPC1-204ENST00000492741 MYH1P12882 1939 aa26.06■■□□□ 1.76
PSPC1-204ENST00000492741 PCP11498 1178 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
PSPC1-204ENST00000492741 FGD1P98174 961 aa26.05■■□□□ 1.76
PSPC1-204ENST00000492741 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
PSPC1-204ENST00000492741 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
PSPC1-204ENST00000492741 MKNK2Q9HBH9 465 aa26.05■■□□□ 1.76
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