RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466278.1

MKL1-208, Transcript of MKL/myocardin-like protein 1, human

TSL 3

Gene MKL1, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKL1-208	ENST00000466278	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		27.93	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		27.93	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	INPP5B	P32019	993 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	RHBDL3	P58872	404 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	PICALM	Q13492	652 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	PDE3A	Q14432	1141 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	PTPN18	Q99952	460 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		27.91	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		27.91	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	IGSF3	O75054	1194 aa		27.91	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	PPIL2	Q13356	520 aa		27.91	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	CCL15	Q16663	113 aa		27.91	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		27.91	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	AACS	Q86V21	672 aa		27.9	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	IRF6	O14896	467 aa		27.89	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	ZAP70	P43403	619 aa		27.89	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	PPAT	Q06203	517 aa		27.89	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	CRHR2	Q13324	411 aa		27.89	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	SNAPC2	Q13487	334 aa		27.89	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		27.89	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		27.89	■■■□□ 2.06
MKL1-208	ENST00000466278	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.05
MKL1-208	ENST00000466278	CETP	P11597	493 aa		27.88	■■■□□ 2.05
MKL1-208	ENST00000466278	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
MKL1-208	ENST00000466278	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		27.87	■■■□□ 2.05
MKL1-208	ENST00000466278	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		27.87	■■■□□ 2.05
MKL1-208	ENST00000466278	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		27.87	■■■□□ 2.05
MKL1-208	ENST00000466278	BAG3	O95817	575 aa		27.86	■■■□□ 2.05
MKL1-208	ENST00000466278	TEX11	Q8IYF3	940 aa		27.86	■■■□□ 2.05
MKL1-208	ENST00000466278	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		27.86	■■■□□ 2.05
MKL1-208	ENST00000466278	PLCG2	P16885	1265 aa		27.85	■■■□□ 2.05
MKL1-208	ENST00000466278	MAP3K10	Q02779	954 aa		27.85	■■■□□ 2.05
MKL1-208	ENST00000466278	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
MKL1-208	ENST00000466278	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
MKL1-208	ENST00000466278	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
MKL1-208	ENST00000466278	DOCK1	Q14185	1865 aa		27.85	■■■□□ 2.05
MKL1-208	ENST00000466278	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
MKL1-208	ENST00000466278	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		27.84	■■■□□ 2.05
MKL1-208	ENST00000466278	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
MKL1-208	ENST00000466278	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		27.83	■■■□□ 2.05
MKL1-208	ENST00000466278	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		27.83	■■■□□ 2.05
MKL1-208	ENST00000466278	APBB1	O00213	710 aa		27.83	■■■□□ 2.05
MKL1-208	ENST00000466278	RAB11FIP3	O75154	756 aa		27.83	■■■□□ 2.05
MKL1-208	ENST00000466278	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		27.83	■■■□□ 2.05
MKL1-208	ENST00000466278	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
MKL1-208	ENST00000466278	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		27.83	■■■□□ 2.05
MKL1-208	ENST00000466278	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	27.83	■■■□□ 2.05
MKL1-208	ENST00000466278	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		27.83	■■■□□ 2.05
MKL1-208	ENST00000466278	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		27.83	■■■□□ 2.05
MKL1-208	ENST00000466278	PPP4C	P60510	307 aa		27.82	■■■□□ 2.04
MKL1-208	ENST00000466278	ERO1A	Q96HE7	468 aa		27.82	■■■□□ 2.04
MKL1-208	ENST00000466278	PICK1	Q9NRD5	415 aa		27.82	■■■□□ 2.04
MKL1-208	ENST00000466278	BTBD19	C9JJ37	291 aa		27.81	■■■□□ 2.04
MKL1-208	ENST00000466278	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
MKL1-208	ENST00000466278	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		27.81	■■■□□ 2.04
MKL1-208	ENST00000466278	TBC1D12	O60347	775 aa		27.8	■■■□□ 2.04
MKL1-208	ENST00000466278	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
MKL1-208	ENST00000466278	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
MKL1-208	ENST00000466278	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
MKL1-208	ENST00000466278	SP3	Q02447	781 aa		27.79	■■■□□ 2.04
MKL1-208	ENST00000466278	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
MKL1-208	ENST00000466278	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		27.79	■■■□□ 2.04
MKL1-208	ENST00000466278	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		27.79	■■■□□ 2.04
MKL1-208	ENST00000466278	CYP7A1	P22680	504 aa		27.78	■■■□□ 2.04
MKL1-208	ENST00000466278	MAP3K12	Q12852	859 aa		27.78	■■■□□ 2.04
MKL1-208	ENST00000466278	CERS3	Q8IU89	383 aa		27.78	■■■□□ 2.04
MKL1-208	ENST00000466278	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	27.78	■■■□□ 2.04
MKL1-208	ENST00000466278	TRIM17	Q9Y577	477 aa		27.78	■■■□□ 2.04
MKL1-208	ENST00000466278	CXCL11	O14625	94 aa		27.77	■■■□□ 2.04
MKL1-208	ENST00000466278	SLURP2	P0DP57	97 aa		27.77	■■■□□ 2.04
MKL1-208	ENST00000466278	PTPRA	P18433	802 aa		27.77	■■■□□ 2.04
MKL1-208	ENST00000466278	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		27.77	■■■□□ 2.04
MKL1-208	ENST00000466278	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		27.77	■■■□□ 2.04
MKL1-208	ENST00000466278	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
MKL1-208	ENST00000466278	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		27.77	■■■□□ 2.04
MKL1-208	ENST00000466278	FLT1	P17948	1338 aa		27.76	■■■□□ 2.03
MKL1-208	ENST00000466278	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
MKL1-208	ENST00000466278	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		27.76	■■■□□ 2.03
MKL1-208	ENST00000466278	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		27.76	■■■□□ 2.03
MKL1-208	ENST00000466278	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	27.76	■■■□□ 2.03
MKL1-208	ENST00000466278	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		27.76	■■■□□ 2.03
MKL1-208	ENST00000466278	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		27.76	■■■□□ 2.03
MKL1-208	ENST00000466278	PTPRF	P10586	1907 aa		27.76	■■■□□ 2.03
MKL1-208	ENST00000466278	SIPA1L1	O43166	1804 aa		27.76	■■■□□ 2.03
MKL1-208	ENST00000466278	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		27.76	■■■□□ 2.03
MKL1-208	ENST00000466278	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		27.76	■■■□□ 2.03
MKL1-208	ENST00000466278	FAM196B	A6NMK8	535 aa		27.75	■■■□□ 2.03
MKL1-208	ENST00000466278	TLR2	O60603	784 aa		27.75	■■■□□ 2.03
MKL1-208	ENST00000466278	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
MKL1-208	ENST00000466278	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		27.74	■■■□□ 2.03
MKL1-208	ENST00000466278	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		27.74	■■■□□ 2.03

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