RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 ZMYM6O95789 1325 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-204ENST00000452765 CACNB3P54284 484 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-204ENST00000452765 CXCL9Q07325 125 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-204ENST00000452765 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-204ENST00000452765 NECAB1Q8N987 351 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-204ENST00000452765 BRF1Q92994 677 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-204ENST00000452765 ME3Q16798 604 aa24.75■■□□□ 1.55
SH3BP2-204ENST00000452765 NCOA7Q8NI08 942 aa24.75■■□□□ 1.55
SH3BP2-204ENST00000452765 TEKT1Q969V4 418 aa24.75■■□□□ 1.55
SH3BP2-204ENST00000452765 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa24.75■■□□□ 1.55
SH3BP2-204ENST00000452765 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa24.75■■□□□ 1.55
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SH3BP2-204ENST00000452765 AKNAD1Q5T1N1 836 aa24.75■■□□□ 1.55
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SH3BP2-204ENST00000452765 SHTN1A0MZ66 631 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3BP2-204ENST00000452765 PRC1O43663 620 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3BP2-204ENST00000452765 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3BP2-204ENST00000452765 MFSD6Q6ZSS7 791 aa24.74■■□□□ 1.55
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SH3BP2-204ENST00000452765 KDM4AO75164 1064 aa24.73■■□□□ 1.55
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SH3BP2-204ENST00000452765 APOBRQ0VD83 1088 aa24.73■■□□□ 1.55
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SH3BP2-204ENST00000452765 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa24.73■■□□□ 1.55
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SH3BP2-204ENST00000452765 MCM2P49736 904 aa24.73■■□□□ 1.55
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SH3BP2-204ENST00000452765 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
SH3BP2-204ENST00000452765 ZSWIM5Q9P217 1185 aa24.73■■□□□ 1.55
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SH3BP2-204ENST00000452765 TRDNQ13061 729 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP2-204ENST00000452765 HHIPL2Q6UWX4 724 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP2-204ENST00000452765 FLT1P17948 1338 aa24.72■■□□□ 1.55
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SH3BP2-204ENST00000452765 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SH3BP2-204ENST00000452765 GIMAP6Q6P9H5 292 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP2-204ENST00000452765 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP2-204ENST00000452765 STAG1Q8WVM7 1258 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP2-204ENST00000452765 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
SH3BP2-204ENST00000452765 SLURP2P0DP57 97 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC83Q8IWF9 413 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP2-204ENST00000452765 MCM5P33992 734 aa24.7■■□□□ 1.55
SH3BP2-204ENST00000452765 GMLQ99445 158 aa24.7■■□□□ 1.55
SH3BP2-204ENST00000452765 VPS33BQ9H267 617 aa24.7■■□□□ 1.55
SH3BP2-204ENST00000452765 NAV1Q8NEY1 1877 aa24.7■■□□□ 1.55
SH3BP2-204ENST00000452765 IGSF3O75054 1194 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
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SH3BP2-204ENST00000452765 SLC44A5Q8NCS7 719 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 ZDHHC15Q96MV8 337 aa24.7■■□□□ 1.54
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SH3BP2-204ENST00000452765 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 MYH1P12882 1939 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 CFAP100Q494V2 611 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 CUL4AQ13619 759 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 C12orf60Q5U649 245 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 TIAM2Q8IVF5 1701 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 PPFIA3O75145 1194 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 PLCG2P16885 1265 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 TCP10Q12799 353 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 DDIT3P35638 169 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 SBK1Q52WX2 424 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM47AQ5JRC9 791 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 CIAPIN1Q6FI81 312 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 LAMB1P07942 1786 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 PKP1Q13835 747 aa24.66■■□□□ 1.54
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SH3BP2-204ENST00000452765 AGXT2Q9BYV1 514 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 GJA3Q9Y6H8 435 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 FOCADQ5VW36 1801 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 ECM29Q5VYK3 1845 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 LTBP3Q9NS15 1303 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 CCT2P78371 535 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
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SH3BP2-204ENST00000452765 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 NMT2O60551 498 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 KRT23Q9C075 422 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 EGFRP00533 1210 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP24.64■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF541Q9H0D2 1346 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP2-204ENST00000452765 CLRN2A0PK11 232 aa24.64■■□□□ 1.53
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