RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449182.1

PTPRZ1-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRZ1, Length 4,627 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-202ENST00000449182 CCNG2Q16589 344 aa7.47□□□□□ -1.21
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PTPRZ1-202ENST00000449182 PNMA1Q8ND90 353 aa7.45□□□□□ -1.22
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PTPRZ1-202ENST00000449182 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
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PTPRZ1-202ENST00000449182 CCDC57Q2TAC2 916 aa7.45□□□□□ -1.22
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PTPRZ1-202ENST00000449182 POTEEQ6S8J3 1075 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRZ1-202ENST00000449182 NLRP14Q86W24 1093 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRZ1-202ENST00000449182 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.22
PTPRZ1-202ENST00000449182 SPATA5Q8NB90 893 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRZ1-202ENST00000449182 CCDC150Q8NCX0 1101 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRZ1-202ENST00000449182 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRZ1-202ENST00000449182 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRZ1-202ENST00000449182 APPL1Q9UKG1 709 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRZ1-202ENST00000449182 KLHL33A6NCF5 533 aa7.45□□□□□ -1.22
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