RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa32.75■■■□□ 2.83
ODC1-204ENST00000446285 LRP2BPQ9P2M1 347 aa32.75■■■□□ 2.83
ODC1-204ENST00000446285 ATRNL1Q5VV63 1379 aa32.74■■■□□ 2.83
ODC1-204ENST00000446285 MAST2Q6P0Q8 1798 aa32.74■■■□□ 2.83
ODC1-204ENST00000446285 IRF6O14896 467 aa32.74■■■□□ 2.83
ODC1-204ENST00000446285 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP32.74■■■□□ 2.83
ODC1-204ENST00000446285 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa32.74■■■□□ 2.83
ODC1-204ENST00000446285 ERC1Q8IUD2 1116 aa32.74■■■□□ 2.83
ODC1-204ENST00000446285 ZFPM1Q8IX07 1006 aa32.74■■■□□ 2.83
ODC1-204ENST00000446285 ZNF384Q8TF68 577 aa32.74■■■□□ 2.83
ODC1-204ENST00000446285 RHBDL3P58872 404 aa32.73■■■□□ 2.83
ODC1-204ENST00000446285 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP32.73■■■□□ 2.83
ODC1-204ENST00000446285 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP32.72■■■□□ 2.83
ODC1-204ENST00000446285 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa32.72■■■□□ 2.83
ODC1-204ENST00000446285 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP32.72■■■□□ 2.83
ODC1-204ENST00000446285 DDX19BQ9UMR2 479 aa32.72■■■□□ 2.83
ODC1-204ENST00000446285 SP3Q02447 781 aa32.71■■■□□ 2.83
ODC1-204ENST00000446285 MAP3K10Q02779 954 aa32.71■■■□□ 2.83
ODC1-204ENST00000446285 FAM43AQ8N2R8 423 aa32.71■■■□□ 2.83
ODC1-204ENST00000446285 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP32.7■■■□□ 2.83
ODC1-204ENST00000446285 PICALMQ13492 652 aa32.7■■■□□ 2.83
ODC1-204ENST00000446285 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP32.7■■■□□ 2.83
ODC1-204ENST00000446285 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP32.7■■■□□ 2.83
ODC1-204ENST00000446285 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP32.7■■■□□ 2.83
ODC1-204ENST00000446285 RCAN3Q9UKA8 241 aa32.7■■■□□ 2.83
ODC1-204ENST00000446285 KCNH4Q9UQ05 1017 aa32.7■■■□□ 2.83
ODC1-204ENST00000446285 TRIM17Q9Y577 477 aa32.7■■■□□ 2.83
ODC1-204ENST00000446285 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa32.69■■■□□ 2.82
ODC1-204ENST00000446285 PHF20L1A8MW92 1017 aa32.68■■■□□ 2.82
ODC1-204ENST00000446285 ARHGEF6Q15052 776 aa32.68■■■□□ 2.82
ODC1-204ENST00000446285 OTOP1Q7RTM1 612 aa32.68■■■□□ 2.82
ODC1-204ENST00000446285 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP32.67■■■□□ 2.82
ODC1-204ENST00000446285 BAG3O95817 575 aa32.67■■■□□ 2.82
ODC1-204ENST00000446285 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP32.67■■■□□ 2.82
ODC1-204ENST00000446285 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP32.67■■■□□ 2.82
ODC1-204ENST00000446285 SCYL3Q8IZE3 742 aa32.67■■■□□ 2.82
ODC1-204ENST00000446285 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP32.67■■■□□ 2.82
ODC1-204ENST00000446285 SNRKQ9NRH2 765 aa32.67■■■□□ 2.82
ODC1-204ENST00000446285 BTBD19C9JJ37 291 aa32.66■■■□□ 2.82
ODC1-204ENST00000446285 TBC1D12O60347 775 aa32.66■■■□□ 2.82
ODC1-204ENST00000446285 PLCG2P16885 1265 aa32.66■■■□□ 2.82
ODC1-204ENST00000446285 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP32.66■■■□□ 2.82
ODC1-204ENST00000446285 PICK1Q9NRD5 415 aa32.66■■■□□ 2.82
ODC1-204ENST00000446285 CXCL11O14625 94 aa32.65■■■□□ 2.82
ODC1-204ENST00000446285 HMMRO75330 724 aa32.65■■■□□ 2.82
ODC1-204ENST00000446285 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP32.65■■■□□ 2.82
ODC1-204ENST00000446285 CD99L2Q8TCZ2 262 aa32.65■■■□□ 2.82
ODC1-204ENST00000446285 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP32.65■■■□□ 2.82
ODC1-204ENST00000446285 EFCC1Q9HA90 598 aa32.65■■■□□ 2.82
ODC1-204ENST00000446285 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa32.65■■■□□ 2.82
ODC1-204ENST00000446285 TLR2O60603 784 aa32.64■■■□□ 2.82
ODC1-204ENST00000446285 DOCK1Q14185 1865 aa32.64■■■□□ 2.82
ODC1-204ENST00000446285 ANKRD23Q86SG2 305 aa32.64■■■□□ 2.82
ODC1-204ENST00000446285 TEX11Q8IYF3 940 aa32.64■■■□□ 2.82
ODC1-204ENST00000446285 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP32.63■■■□□ 2.81
ODC1-204ENST00000446285 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP32.63■■■□□ 2.81
ODC1-204ENST00000446285 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa32.63■■■□□ 2.81
ODC1-204ENST00000446285 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP32.63■■■□□ 2.81
ODC1-204ENST00000446285 COG6Q9Y2V7 657 aa32.63■■■□□ 2.81
ODC1-204ENST00000446285 ZAP70P43403 619 aa32.62■■■□□ 2.81
ODC1-204ENST00000446285 PPP4CP60510 307 aa32.62■■■□□ 2.81
ODC1-204ENST00000446285 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP32.62■■■□□ 2.81
ODC1-204ENST00000446285 SOX10P56693 466 aa32.61■■■□□ 2.81
ODC1-204ENST00000446285 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP32.61■■■□□ 2.81
ODC1-204ENST00000446285 PTPRAP18433 802 aa32.6■■■□□ 2.81
ODC1-204ENST00000446285 AACSQ86V21 672 aa32.6■■■□□ 2.81
ODC1-204ENST00000446285 PTPN22Q9Y2R2 807 aa32.6■■■□□ 2.81
ODC1-204ENST00000446285 CERS3Q8IU89 383 aa32.59■■■□□ 2.81
ODC1-204ENST00000446285 RHPN1Q8TCX5 695 aa32.59■■■□□ 2.81
ODC1-204ENST00000446285 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP32.59■■■□□ 2.81
ODC1-204ENST00000446285 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP32.59■■■□□ 2.81
ODC1-204ENST00000446285 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP32.59■■■□□ 2.81
ODC1-204ENST00000446285 ZHX2Q9Y6X8 837 aa32.59■■■□□ 2.81
ODC1-204ENST00000446285 PDE3AQ14432 1141 aa32.58■■■□□ 2.81
ODC1-204ENST00000446285 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP32.58■■■□□ 2.81
ODC1-204ENST00000446285 KIF1BPQ96EK5 621 aa32.58■■■□□ 2.81
ODC1-204ENST00000446285 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP32.58■■■□□ 2.81
ODC1-204ENST00000446285 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP32.58■■■□□ 2.81
ODC1-204ENST00000446285 FOCADQ5VW36 1801 aa32.58■■■□□ 2.81
ODC1-204ENST00000446285 HTTP42858 3142 aa32.57■■■□□ 2.81
ODC1-204ENST00000446285 PDHXO00330 501 aa32.57■■■□□ 2.8
ODC1-204ENST00000446285 KIF22Q14807 665 aa32.57■■■□□ 2.8
ODC1-204ENST00000446285 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP32.57■■■□□ 2.8
ODC1-204ENST00000446285 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP32.57■■■□□ 2.8
ODC1-204ENST00000446285 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa32.57■■■□□ 2.8
ODC1-204ENST00000446285 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP32.56■■■□□ 2.8
ODC1-204ENST00000446285 MOGSQ13724 837 aa32.56■■■□□ 2.8
ODC1-204ENST00000446285 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP32.56■■■□□ 2.8
ODC1-204ENST00000446285 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa32.56■■■□□ 2.8
ODC1-204ENST00000446285 PHIPQ8WWQ0 1821 aa32.56■■■□□ 2.8
ODC1-204ENST00000446285 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP32.55■■■□□ 2.8
ODC1-204ENST00000446285 PI4KBQ9UBF8 816 aa32.55■■■□□ 2.8
ODC1-204ENST00000446285 PTPRFP10586 1907 aa32.55■■■□□ 2.8
ODC1-204ENST00000446285 RAB11FIP3O75154 756 aa32.54■■■□□ 2.8
ODC1-204ENST00000446285 GNRH1P01148 92 aa32.54■■■□□ 2.8
ODC1-204ENST00000446285 C17orf99Q6UX52 265 aa32.54■■■□□ 2.8
ODC1-204ENST00000446285 ADGRA1Q86SQ6 560 aa32.54■■■□□ 2.8
ODC1-204ENST00000446285 TBC1D2Q9BYX2 928 aa32.54■■■□□ 2.8
ODC1-204ENST00000446285 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa32.54■■■□□ 2.8
ODC1-204ENST00000446285 IDH1O75874 414 aaKnown RBP32.53■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.7 ms