RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446281.5

LMCD1-AS1-204, LMCD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LMCD1-AS1, Length 932 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 TAF6LQ9Y6J9 622 aa23.12■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 MINDY4BA8MYZ0 360 aa23.11■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 MYO1BO43795 1136 aa23.11■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 PPARAQ07869 468 aa23.11■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 PICALMQ13492 652 aa23.11■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa23.11■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 SPDYE2Q495Y8 402 aa23.11■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 SAMD7Q7Z3H4 446 aa23.11■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 TMOD2Q9NZR1 351 aa23.11■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 GLTPD2A6NH11 291 aa23.1■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 E7EWF7 191 aa23.1■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 EPS15P42566 896 aa23.1■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 NFIAQ12857 509 aa23.1■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 NBPF9Q3BBW0 867 aa23.1■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 AMOTL1Q8IY63 956 aa23.1■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 TM6SF1Q9BZW5 370 aa23.1■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 NBPF3Q9H094 633 aa23.1■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa23.09■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ENTPD3O75355 529 aa23.09■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 EGFRP00533 1210 aa23.09■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CACNB3P54284 484 aa23.09■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ADCK5Q3MIX3 580 aa23.09■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 C12orf60Q5U649 245 aa23.09■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 FKBP1CQ5VVH2 108 aa23.09■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 FAM198AQ9UFP1 575 aa23.09■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 FOCADQ5VW36 1801 aa23.09■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ECM29Q5VYK3 1845 aa23.08■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23.08■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CLRN2A0PK11 232 aa23.08■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CYP2D6P10635 497 aa23.08■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 PSMA5P28066 241 aa23.08■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CTDSPL2Q05D32 466 aa23.08■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 RABEP1Q15276 862 aa23.08■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 STOX1Q6ZVD7 989 aa23.08■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 TBC1D10CQ8IV04 446 aa23.08■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 NAV1Q8NEY1 1877 aa23.08■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 LAMA4Q16363 1823 aa23.08■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 STAG1Q8WVM7 1258 aa23.07■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 NEK1Q96PY6 1258 aa23.07■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 AKNAD1Q5T1N1 836 aa23.06■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 TTC6Q86TZ1 520 aa23.06■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 TRPM4Q8TD43 1214 aa23.06■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 VEZTQ9HBM0 779 aa23.06■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa23.06■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.05■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 PLCD1P51178 756 aa23.05■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 TCP10Q12799 353 aa23.05■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ZFPM1Q8IX07 1006 aa23.05■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 FAM151AQ8WW52 585 aa23.05■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 HACL1Q9UJ83 578 aa23.05■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 TACC3Q9Y6A5 838 aa23.05■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ROBO3Q96MS0 1386 aa23.04■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 SMIM22K7EJ46 135 aa23.04■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 PCP11498 1178 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CASTP20810 708 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 EVX2Q03828 476 aa23.04■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa23.04■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa23.04■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 MFSD6Q6ZSS7 791 aa23.04■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 FAM83AQ86UY5 434 aa23.04■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 IL27Q8NEV9 243 aa23.04■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 NCOA7Q8NI08 942 aa23.04■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 LAMB1P07942 1786 aa23.04■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 HLA-DOAP06340 250 aa23.03■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 FGRP09769 529 aa23.03■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 TNNI2P48788 182 aa23.03■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 TRDNQ13061 729 aa23.03■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 STK11IPQ8N1F8 1099 aa23.03■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CNNM2Q9H8M5 875 aa23.03■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa23.03■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CNTNAP1P78357 1384 aa23.02■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 RUFY3Q7L099 469 aa23.02■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa23.02■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 KRT23Q9C075 422 aa23.02■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 INCENPQ9NQS7 918 aa23.02■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP23.02■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 MYH1P12882 1939 aa23.02■■□□□ 1.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ATRNL1Q5VV63 1379 aa23.01■■□□□ 1.27
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa23.01■■□□□ 1.27
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 RPS6KB1P23443 525 aa23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms