RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389416.8

PTPRN2-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,692 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-202ENST00000389416 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRN2-202ENST00000389416 CPXCR1Q8N123 301 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRN2-202ENST00000389416 TCP10L2B9ZVM9 353 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRN2-202ENST00000389416 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRN2-202ENST00000389416 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRN2-202ENST00000389416 ESPNB1AK53 854 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 TBCAO75347 108 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 SP4Q02446 784 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 ADCK5Q3MIX3 580 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 CCDC40Q4G0X9 1142 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 KRT79Q5XKE5 535 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 ZNF654Q8IZM8 581 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 MAP4K1Q92918 833 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 VWA3AA6NCI4 1184 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 ADD1P35611 737 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 ASIC1P78348 528 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 GRAPQ13588 217 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 RRAGBQ5VZM2 374 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 DTHD1Q6ZMT9 781 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 SYCP3Q8IZU3 236 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 EXOC1Q9NV70 894 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 KCNJ14Q9UNX9 436 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 A0A1B0GVL5 298 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 RASGRF1Q13972 1273 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 VWDEQ8N2E2 1590 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 ADCY9O60503 1353 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 CYP21A2P08686 494 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 OSBP2Q969R2 916 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 TRIM47Q96LD4 638 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 ISCA1Q9BUE6 129 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 PKD2L1Q9P0L9 805 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 ANO6Q4KMQ2 910 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 TNKSO95271 1327 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 PRKAB2O43741 272 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 DIXDC1Q155Q3 683 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 KRT40Q6A162 431 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 DNAJC25Q9H1X3 360 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 RAD17O75943 681 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 GPS2Q13227 327 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 RILPL1Q5EBL4 403 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 LRSAM1Q6UWE0 723 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 NRKQ7Z2Y5 1582 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 ADCY5O95622 1261 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 MTX1Q13505 466 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 TPCN1Q9ULQ1 816 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 CLRN2A0PK11 232 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 VPS54Q9P1Q0 977 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 ADD2P35612 726 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 CDC37L1Q7L3B6 337 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 KIAA1328Q86T90 577 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 SSH2Q76I76 1423 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 SEMA3EO15041 775 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 TMC4Q7Z404 712 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 PI4K2BQ8TCG2 481 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 TMC6Q7Z403 805 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 UIMC1Q96RL1 719 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 LRRC27Q9C0I9 530 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 M0R2C6 588 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 ZBTB7AO95365 584 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 USH1GQ495M9 461 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 SLFNL1Q499Z3 407 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.023e-7■■■■■ 33.4
PTPRN2-202ENST00000389416 NPR1P16066 1061 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 GTF3C6Q969F1 213 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 N4BP3O15049 544 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 NFIXQ14938 502 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 ANO1Q5XXA6 986 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 PNMA1Q8ND90 353 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 C21orf2O43822 256 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 MCAMP43121 646 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 RMND1Q9NWS8 449 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 MINPP1Q9UNW1 487 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRN2-202ENST00000389416 LCORLQ8N3X6 602 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms