RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 PFDN4Q9NQP4 134 aa15.41■□□□□ 0.06
CTIF-202ENST00000382998 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
CTIF-202ENST00000382998 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
CTIF-202ENST00000382998 MAP3K11Q16584 847 aa15.4■□□□□ 0.06
CTIF-202ENST00000382998 ANKRD7Q92527 254 aa15.4■□□□□ 0.06
CTIF-202ENST00000382998 PIK3R4Q99570 1358 aa15.4■□□□□ 0.06
CTIF-202ENST00000382998 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa15.4■□□□□ 0.06
CTIF-202ENST00000382998 TUBB4AP04350 444 aa15.4■□□□□ 0.06
CTIF-202ENST00000382998 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
CTIF-202ENST00000382998 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
CTIF-202ENST00000382998 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa15.4■□□□□ 0.06
CTIF-202ENST00000382998 FBXW10Q5XX13 1052 aa15.4■□□□□ 0.06
CTIF-202ENST00000382998 NUP62CLQ9H1M0 184 aa15.4■□□□□ 0.06
CTIF-202ENST00000382998 AFF2P51816 1311 aa15.4■□□□□ 0.06
CTIF-202ENST00000382998 ZNF521Q96K83 1311 aa15.4■□□□□ 0.06
CTIF-202ENST00000382998 VAMP4O75379 141 aa15.4■□□□□ 0.06
CTIF-202ENST00000382998 CLTAP09496 248 aa15.4■□□□□ 0.06
CTIF-202ENST00000382998 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
CTIF-202ENST00000382998 SPAG5Q96R06 1193 aa15.4■□□□□ 0.06
CTIF-202ENST00000382998 NACA2Q9H009 215 aa15.4■□□□□ 0.06
CTIF-202ENST00000382998 PRELID1Q9Y255 219 aa15.4■□□□□ 0.06
CTIF-202ENST00000382998 ERICH2A1L162 156 aa15.4■□□□□ 0.06
CTIF-202ENST00000382998 LSM1O15116 133 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
CTIF-202ENST00000382998 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
CTIF-202ENST00000382998 RPS6KA3P51812 740 aa15.4■□□□□ 0.06
CTIF-202ENST00000382998 GNG11P61952 73 aa15.4■□□□□ 0.06
CTIF-202ENST00000382998 CAVIN4Q5BKX8 364 aa15.4■□□□□ 0.06
CTIF-202ENST00000382998 TPTE2Q6XPS3 522 aa15.4■□□□□ 0.06
CTIF-202ENST00000382998 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa15.4■□□□□ 0.06
CTIF-202ENST00000382998 SEPT12Q8IYM1 358 aa15.4■□□□□ 0.06
CTIF-202ENST00000382998 TCP11Q8WWU5 503 aa15.4■□□□□ 0.06
CTIF-202ENST00000382998 TRIM7Q9C029 511 aa15.4■□□□□ 0.06
CTIF-202ENST00000382998 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
CTIF-202ENST00000382998 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa15.39■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 BTN2A1Q7KYR7 527 aa15.39■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 KRT27Q7Z3Y8 459 aa15.39■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 ANKRD23Q86SG2 305 aa15.39■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 DNAJC10Q8IXB1 793 aa15.39■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 CCDC24Q8N4L8 307 aa15.39■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 PPFIBP2Q8ND30 876 aa15.39■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 TRIM58Q8NG06 486 aa15.39■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 GSDMDP57764 484 aa15.39■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 CNNM3Q8NE01 707 aa15.39■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 RHBDL2Q9NX52 303 aa15.39■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa15.39■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP15.39■□□□□ 0.053e-6■■■□□ 16.2
CTIF-202ENST00000382998 PPP2R3AQ06190 1150 aa15.39■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa15.39■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 PPFIBP1Q86W92 1011 aa15.39■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 TMOD2Q9NZR1 351 aa15.39■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 MAP3K5Q99683 1374 aa15.38■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 CPLX1O14810 134 aa15.38■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 IL13P35225 146 aa15.38■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 SLC44A4Q53GD3 710 aa15.38■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 SPECC1Q5M775 1068 aa15.38■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 CNTROBQ8N137 903 aa15.38■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa15.38■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 STK24Q9Y6E0 443 aa15.38■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 KMT5BQ4FZB7 885 aa15.38■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 BMP2KLQ5H9B9 411 aa15.38■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 ZNF790Q6PG37 636 aa15.38■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 ARHGEF25Q86VW2 580 aa15.38■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 DIP2BQ9P265 1576 aa15.38■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 SHROOM2Q13796 1616 aa15.38■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 A1BGP04217 495 aa15.38■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 CUL4BQ13620 913 aa15.38■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 HAUS1Q96CS2 278 aa15.38■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 DRC3Q9H069 523 aa15.38■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 KCNQ4P56696 695 aa15.37■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 NLRP5P59047 1200 aa15.37■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 RCN1Q15293 331 aa15.37■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 UNC5CLQ8IV45 518 aa15.37■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 TBCAO75347 108 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 KIF11P52732 1056 aa15.37■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 MAGEA8P43361 318 aa15.37■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 TSHZ3Q63HK5 1081 aa15.37■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 ATP6V0A1Q93050 837 aa15.37■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 MEIS3Q99687 375 aa15.37■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 ANKRD62A6NC57 917 aa15.37■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 CORO7P57737 925 aa15.37■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 SCRN1Q12765 414 aa15.37■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP15.37■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP15.37■□□□□ 0.056e-6■■■□□ 19.2
CTIF-202ENST00000382998 MAF1Q9H063 256 aa15.37■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa15.36■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 MAP3K7CLP57077 242 aa15.36■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 RUFY3Q7L099 469 aa15.36■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa15.36■□□□□ 0.05
CTIF-202ENST00000382998 ATP11CQ8NB49 1132 aa15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78 ms