RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373162.5

TRAPPC3-202, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,056 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-202ENST00000373162 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 GTF2A2P52657 109 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 CRHR2Q13324 411 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 PPIL2Q13356 520 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 COG6Q9Y2V7 657 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 AK9Q5TCS8 1911 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 IRF6O14896 467 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 IGSF3O75054 1194 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 FKTNO75072 461 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 CAP1Q01518 475 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 DOCK1Q14185 1865 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 SLURP2P0DP57 97 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 PPATQ06203 517 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 MOGSQ13724 837 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 CCL15Q16663 113 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 SNRKQ9NRH2 765 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 PTPRFP10586 1907 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZAP70P43403 619 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 LDHCP07864 332 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 GSTO1P78417 241 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 PDE3AQ14432 1141 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 PPP4CP60510 307 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 RAI14Q9P0K7 980 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 BTBD19C9JJ37 291 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 TBC1D12O60347 775 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 CETPP11597 493 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 SLC34A2O95436 690 aa22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 SNAPC2Q13487 334 aa22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 PICALMQ13492 652 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 PTPRAP18433 802 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 AACSQ86V21 672 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 SP3Q02447 781 aa22■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 GPAT2Q6NUI2 795 aa22■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 ANKRD23Q86SG2 305 aa22■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 TEX11Q8IYF3 940 aa22■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 LOC285556D6RIA3 1793 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 CXCL11O14625 94 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 TLR2O60603 784 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 HMMRO75330 724 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 ERO1AQ96HE7 468 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 FAM196BA6NMK8 535 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 DNAJC18Q9H819 358 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 FLT1P17948 1338 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 RAB11FIP3O75154 756 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 PLCG2P16885 1265 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC3-202ENST00000373162 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
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