RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 AK2P54819 239 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 METTL24Q5JXM2 366 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC170Q8IYT3 715 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 MKNK2Q9HBH9 465 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 MFSD6Q6ZSS7 791 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 SDCCAG3Q96C92 435 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 FRMD3A2A2Y4 597 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 CDK19Q9BWU1 502 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIM42Q8IWZ5 723 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 PPP4R1Q8TF05 950 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 CCT6BQ92526 530 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 KDM5DQ9BY66 1539 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 AFMP43652 599 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM67Q5HYA8 995 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIM68Q6AZZ1 485 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 CNNM4Q6P4Q7 775 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 GAS2L3Q86XJ1 694 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 PRAM1Q96QH2 718 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 SPZ1Q9BXG8 430 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 PFDN1O60925 122 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 GNA14O95837 355 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 TSHZ3Q63HK5 1081 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 IQUBQ8NA54 791 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 BCAS4Q8TDM0 211 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 LDHCP07864 332 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIML1Q8N9V2 468 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 BBOF1Q8ND07 529 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 KIF11P52732 1056 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 GRK7Q8WTQ7 553 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 RABEP2Q9H5N1 569 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 PDE11AQ9HCR9 933 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC25Q86WR0 208 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 HS2ST1Q7LGA3 356 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 MYO1CO00159 1063 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 GNA11P29992 359 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 TMCO4Q5TGY1 634 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 PLCD1P51178 756 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIM58Q8NG06 486 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 STX10O60499 249 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 RUBCNQ92622 972 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC26A6Q9BXS9 759 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 TXLNGQ9NUQ3 528 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 A0A1B0GW55 424 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 DUX4L2P0CJ85 424 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 DUX4L3P0CJ86 424 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 DUX4L4P0CJ87 422 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 DUX4L5P0CJ88 424 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 DUX4L6P0CJ89 424 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 DUX4L7P0CJ90 424 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 GNGT1P63211 74 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 MICU3Q86XE3 530 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 GPT2Q8TD30 523 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 RABGGTAQ92696 567 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 DUX4Q9UBX2 424 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 ARHGAP4P98171 946 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 TPCN1Q9ULQ1 816 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 MSH6P52701 1360 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 LIN9Q5TKA1 542 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 KIFC3Q9BVG8 833 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 TMOD4Q9NZQ9 345 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 ABCF2Q9UG63 623 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 KRT3P12035 628 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 SEPT10Q9P0V9 454 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 ITIH3Q06033 890 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 ESR2Q92731 530 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM204AQ9H8W3 233 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM169AQ9Y6X4 670 aa11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.6 ms