RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 FAM173BQ6P4H8 233 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-201ENST00000336128 CTR9Q6PD62 1173 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-201ENST00000336128 APOA5Q6Q788 366 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-201ENST00000336128 CAMKK2Q96RR4 588 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-201ENST00000336128 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ZNF548-201ENST00000336128 CPLX1O14810 134 aa14.58□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa14.58□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM63CQ9P1W3 806 aa14.58□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 ZBTB43O43298 467 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF445P59923 1031 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 SLC15A2Q16348 729 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 GAS2L3Q86XJ1 694 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 MASTLQ96GX5 879 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 MTA3Q9BTC8 594 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 STK32BQ9NY57 414 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 QSER1Q2KHR3 1735 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 CCDC69A6NI79 296 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 GOLGA8AA7E2F4 631 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 USP17L12C9JPN9 530 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 USP17L21D6R901 530 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 UBE2HP62256 183 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 SART3Q15020 963 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 MICU3Q86XE3 530 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 ESR2Q92731 530 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 RXRAP19793 462 aa14.56□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 ALDH1B1P30837 517 aa14.56□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 WTAPQ15007 396 aa14.56□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 DIXDC1Q155Q3 683 aa14.56□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 MYL10Q9BUA6 226 aa14.56□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 SLC12A7Q9Y666 1083 aa14.56□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa14.56□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 NID2Q14112 1375 aa14.56□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 MYH15Q9Y2K3 1946 aa14.56□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 ERICH2A1L162 156 aa14.56□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 LDHCP07864 332 aa14.56□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 PCP11498 1178 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 RIMBP2O15034 1052 aa14.55□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 CDKL5O76039 1030 aa14.55□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 FGRP09769 529 aa14.55□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 CYP2D6P10635 497 aa14.55□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 CDC27P30260 824 aa14.55□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 ADD1P35611 737 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 MRE11P49959 708 aa14.55□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 GUCY1B3Q02153 619 aa14.55□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 SBK1Q52WX2 424 aa14.55□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 OLFM4Q6UX06 510 aa14.55□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa14.55□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 TTC6Q86TZ1 520 aa14.55□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 C2CD5Q86YS7 1000 aa14.55□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa14.55□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 MPNDQ8N594 471 aa14.55□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 UBAC1Q9BSL1 405 aa14.55□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 BAG3O95817 575 aa14.54□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 PPP4CP60510 307 aa14.54□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 EVX2Q03828 476 aa14.54□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 COA1Q9GZY4 146 aa14.54□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 GRPEL1Q9HAV7 217 aa14.54□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 ELP1O95163 1332 aa14.54□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 FAM205AQ6ZU69 1335 aa14.54□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 ECM29Q5VYK3 1845 aa14.54□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 NAV1Q8NEY1 1877 aa14.54□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 USP5P45974 858 aa14.54□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 MFSD14BQ5SR56 506 aa14.54□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa14.54□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 C8orf76Q96K31 380 aa14.54□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 TNKSO95271 1327 aa14.54□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 MYH2Q9UKX2 1941 aa14.54□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 ORC4O43929 436 aa14.53□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 PRDM1O75626 825 aa14.53□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 SEC23AQ15436 765 aa14.53□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 TPRNQ4KMQ1 711 aa14.53□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 TMTC2Q8N394 836 aa14.53□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 DLEC1Q9Y238 1755 aa14.53□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 USP17L8P0C7I0 530 aa14.53□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa14.53□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 STYK1Q6J9G0 422 aa14.53□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 FBXO41Q8TF61 875 aa14.53□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 SPATA32Q96LK8 384 aa14.53□□□□□ -0.08
ZNF548-201ENST00000336128 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms