RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 MINDY4BA8MYZ0 360 aa25.28■■□□□ 1.64
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SPHK1-201ENST00000323374 CLIC4Q9Y696 253 aa25.28■■□□□ 1.64
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SPHK1-201ENST00000323374 CACNA1SQ13698 1873 aa25.28■■□□□ 1.64
SPHK1-201ENST00000323374 TM4SF1P30408 202 aa25.28■■□□□ 1.64
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SPHK1-201ENST00000323374 A0A1W2PQD8 194 aa25.27■■□□□ 1.64
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SPHK1-201ENST00000323374 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.26■■□□□ 1.63
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SPHK1-201ENST00000323374 AFF2P51816 1311 aa25.25■■□□□ 1.63
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SPHK1-201ENST00000323374 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa25.24■■□□□ 1.63
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SPHK1-201ENST00000323374 ZNF654Q8IZM8 581 aa25.21■■□□□ 1.63
SPHK1-201ENST00000323374 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
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SPHK1-201ENST00000323374 CTR9Q6PD62 1173 aa25.19■■□□□ 1.62
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SPHK1-201ENST00000323374 PRDX5P30044 214 aa25.18■■□□□ 1.62
SPHK1-201ENST00000323374 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SPHK1-201ENST00000323374 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.62
SPHK1-201ENST00000323374 LEMD3Q9Y2U8 911 aa25.18■■□□□ 1.62
SPHK1-201ENST00000323374 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa25.18■■□□□ 1.62
SPHK1-201ENST00000323374 SMIM22K7EJ46 135 aa25.18■■□□□ 1.62
SPHK1-201ENST00000323374 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
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