RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MRIQ9BWK5 157 aa28.33■■■□□ 2.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ECM29Q5VYK3 1845 aa28.33■■■□□ 2.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NAV1Q8NEY1 1877 aa28.33■■■□□ 2.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 USP17L12C9JPN9 530 aa28.32■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 USP17L21D6R901 530 aa28.32■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NBR1Q14596 966 aa28.32■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C9orf131Q5VYM1 1079 aa28.32■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TCEANC2Q96MN5 208 aa28.32■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa28.32■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FOCADQ5VW36 1801 aa28.32■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PICALMQ13492 652 aa28.32■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CHMP5Q9NZZ3 219 aa28.32■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FLT1P17948 1338 aa28.31■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLCG2P16885 1265 aa28.31■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MCM2P49736 904 aa28.31■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MCM9Q9NXL9 1143 aa28.31■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EGFRP00533 1210 aa28.3■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NFIAQ12857 509 aa28.3■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OGFOD1Q8N543 542 aa28.3■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PPARAQ07869 468 aa28.29■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GIMAP6Q6P9H5 292 aa28.29■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa28.29■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HDAC9Q9UKV0 1011 aa28.29■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LAMB1P07942 1786 aa28.29■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DDIT3P35638 169 aa28.29■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NEK1Q96PY6 1258 aa28.29■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NEDD4P46934 1319 aa28.28■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPDYE2BA6NHP3 402 aa28.27■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPDYE6P0CI01 402 aa28.27■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CERS3Q8IU89 383 aa28.27■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TM6SF1Q9BZW5 370 aa28.27■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYH1P12882 1939 aa28.27■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KRT32Q14532 448 aa28.27■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DLGAP5Q15398 846 aa28.27■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RUFY3Q7L099 469 aa28.27■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CHST3Q7LGC8 479 aa28.27■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZFPM1Q8IX07 1006 aa28.27■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MICALL2Q8IY33 904 aa28.27■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa28.26■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TTC14Q96N46 770 aa28.26■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CLRN2A0PK11 232 aa28.25■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RPS12P25398 132 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLCD1P51178 756 aa28.25■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NFKBIBQ15653 356 aa28.25■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LRRC2Q9BYS8 371 aa28.25■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYOZ2Q9NPC6 264 aa28.25■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa28.25■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DDNO94850 711 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PSMA5P28066 241 aa28.25■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SAMD7Q7Z3H4 446 aa28.25■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TCP10Q12799 353 aa28.24■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NBPF9Q3BBW0 867 aa28.24■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SBK1Q52WX2 424 aa28.24■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM198AQ9UFP1 575 aa28.24■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ANAPC4Q9UJX5 808 aa28.24■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AKNAD1Q5T1N1 836 aa28.23■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C12orf60Q5U649 245 aa28.23■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DPF2Q92785 391 aa28.23■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DYNLL2Q96FJ2 89 aa28.23■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 B4E1Z4 1266 aa28.22■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPC2Q8N158 579 aa28.22■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PDRG1Q9NUG6 133 aa28.22■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 WNT10BO00744 389 aa28.22■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GRIN3BO60391 1043 aa28.22■■■□□ 2.11
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AK2P54819 239 aa28.22■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 STAG1Q8WVM7 1258 aa28.22■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLURP2P0DP57 97 aa28.21■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MFSD6Q6ZSS7 791 aa28.2■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CYB5R4Q7L1T6 521 aa28.2■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MTMR14Q8NCE2 650 aa28.2■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NCOA7Q8NI08 942 aa28.2■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TOMM22Q9NS69 142 aa28.2■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FOXD4L1Q9NU39 408 aa28.2■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TCP10L2B9ZVM9 353 aa28.2■■■□□ 2.1
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