RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000286428.5

VBP1-201, Transcript of VHL binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VBP1, Length 1,686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1-201ENST00000286428 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 ATL3Q6DD88 541 aa22.18■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.18■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.18■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.17■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 FGRP09769 529 aa22.17■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 WTAPQ15007 396 aa22.17■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 IQCA1Q86XH1 822 aa22.17■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 KLHL34Q8N239 644 aa22.17■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 LY9Q9HBG7 655 aa22.17■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 CFAP45Q9UL16 551 aa22.17■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.17■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 MAST2Q6P0Q8 1798 aa22.17■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 PDE4BQ07343 736 aa22.17■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 CTR9Q6PD62 1173 aa22.17■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 APOA5Q6Q788 366 aa22.17■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
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VBP1-201ENST00000286428 CNKSR1Q969H4 720 aa22.16■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.16■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 USP17L12C9JPN9 530 aa22.15■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 USP17L21D6R901 530 aa22.15■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 G3V3G9 751 aa22.15■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 USP5P45974 858 aa22.15■■□□□ 1.14
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VBP1-201ENST00000286428 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.15■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.15■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.15■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.14■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 GPT2Q8TD30 523 aa22.14■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.14■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 ELP1O95163 1332 aa22.14■■□□□ 1.14
VBP1-201ENST00000286428 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.14■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 EP400Q96L91 3159 aa22.14■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 GOLGA8AA7E2F4 631 aa22.14■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 ORC4O43929 436 aa22.14■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 MRE11P49959 708 aa22.14■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 MSL1Q68DK7 614 aa22.14■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.14■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 WASF1Q92558 559 aa22.14■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 JAG2Q9Y219 1238 aa22.14■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.13■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 FSD2A1L4K1 749 aa22.13■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 FIBPO43427 364 aa22.13■■□□□ 1.13
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VBP1-201ENST00000286428 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.13■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 C8orf76Q96K31 380 aa22.13■■□□□ 1.13
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VBP1-201ENST00000286428 FERMT3Q86UX7 667 aa22.12■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.12■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 CALM1P0DP23 149 aa22.11■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 CALM2P0DP24 149 aa22.11■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 CALM3P0DP25 149 aa22.11■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 RESTQ13127 1097 aa22.11■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 MICU3Q86XE3 530 aa22.11■■□□□ 1.13
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VBP1-201ENST00000286428 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.11■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 INCENPQ9NQS7 918 aa22.11■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.11■■□□□ 1.13
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VBP1-201ENST00000286428 PODNQ7Z5L7 613 aa22.11■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.11■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.11■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.1■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 STK36Q9NRP7 1315 aa22.1■■□□□ 1.13
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VBP1-201ENST00000286428 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.1■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.1■■□□□ 1.13
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VBP1-201ENST00000286428 GTF2IP78347 998 aa22.09■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
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VBP1-201ENST00000286428 RTN1Q16799 776 aa22.09■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.09■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa22.09■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 SPATA32Q96LK8 384 aa22.09■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 TNKSO95271 1327 aa22.08■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 BTDP43251 543 aa22.08■■□□□ 1.13
VBP1-201ENST00000286428 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
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