RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246139.9

CITED1-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 1,231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-201ENST00000246139 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa25.63■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa25.62■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 SPDYE5A6NIY4 337 aa25.62■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 CCL15Q16663 113 aa25.62■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 ERO1BQ86YB8 467 aa25.62■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 SIRT2Q8IXJ6 389 aa25.62■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 ZNF384Q8TF68 577 aa25.62■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 MS4A4AQ96JQ5 239 aa25.62■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 IDI2Q9BXS1 227 aa25.62■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 TRIM17Q9Y577 477 aa25.62■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 ENTPD3O75355 529 aa25.61■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 CRHR2Q13324 411 aa25.61■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 PICALMQ13492 652 aa25.61■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 OTOP1Q7RTM1 612 aa25.61■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa25.6■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 INPP5BP32019 993 aa25.6■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 AACSQ86V21 672 aa25.6■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.6■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 BRI3BPQ8WY22 251 aa25.6■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 APBB1O00213 710 aa25.59■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.59■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 BRCA2P51587 3418 aa25.59■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 ZAP70P43403 619 aa25.58■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 CD99L2Q8TCZ2 262 aa25.58■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 MYH2Q9UKX2 1941 aa25.58■■□□□ 1.69
CITED1-201ENST00000246139 IRF6O14896 467 aa25.57■■□□□ 1.68
CITED1-201ENST00000246139 CETPP11597 493 aa25.57■■□□□ 1.68
CITED1-201ENST00000246139 PPIL2Q13356 520 aa25.57■■□□□ 1.68
CITED1-201ENST00000246139 SNAPC2Q13487 334 aa25.57■■□□□ 1.68
CITED1-201ENST00000246139 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
CITED1-201ENST00000246139 ZNF112Q9UJU3 913 aa25.57■■□□□ 1.68
CITED1-201ENST00000246139 RHBDL3P58872 404 aa25.56■■□□□ 1.68
CITED1-201ENST00000246139 PPATQ06203 517 aa25.56■■□□□ 1.68
CITED1-201ENST00000246139 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.56■■□□□ 1.68
CITED1-201ENST00000246139 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
CITED1-201ENST00000246139 POTEFA5A3E0 1075 aa25.55■■□□□ 1.68
CITED1-201ENST00000246139 RAB11FIP3O75154 756 aa25.55■■□□□ 1.68
CITED1-201ENST00000246139 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
CITED1-201ENST00000246139 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
CITED1-201ENST00000246139 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa25.55■■□□□ 1.68
CITED1-201ENST00000246139 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
CITED1-201ENST00000246139 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa25.55■■□□□ 1.68
CITED1-201ENST00000246139 RFX7Q2KHR2 1363 aa25.55■■□□□ 1.68
CITED1-201ENST00000246139 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
CITED1-201ENST00000246139 FAM43AQ8N2R8 423 aa25.54■■□□□ 1.68
CITED1-201ENST00000246139 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
CITED1-201ENST00000246139 PTPN22Q9Y2R2 807 aa25.54■■□□□ 1.68
CITED1-201ENST00000246139 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CITED1-201ENST00000246139 ERO1AQ96HE7 468 aa25.53■■□□□ 1.68
CITED1-201ENST00000246139 BCL11AQ9H165 835 aa25.53■■□□□ 1.68
CITED1-201ENST00000246139 BAG3O95817 575 aa25.52■■□□□ 1.68
CITED1-201ENST00000246139 SP3Q02447 781 aa25.52■■□□□ 1.68
CITED1-201ENST00000246139 TEX11Q8IYF3 940 aa25.52■■□□□ 1.68
CITED1-201ENST00000246139 PICK1Q9NRD5 415 aa25.52■■□□□ 1.68
CITED1-201ENST00000246139 AK9Q5TCS8 1911 aa25.51■■□□□ 1.67
CITED1-201ENST00000246139 BTBD19C9JJ37 291 aa25.51■■□□□ 1.67
CITED1-201ENST00000246139 IGSF3O75054 1194 aa25.51■■□□□ 1.67
CITED1-201ENST00000246139 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CITED1-201ENST00000246139 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CITED1-201ENST00000246139 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP25.51■■□□□ 1.67
CITED1-201ENST00000246139 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa25.51■■□□□ 1.67
CITED1-201ENST00000246139 PHF20L1A8MW92 1017 aa25.5■■□□□ 1.67
CITED1-201ENST00000246139 NPM3O75607 178 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
CITED1-201ENST00000246139 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
CITED1-201ENST00000246139 EFCC1Q9HA90 598 aa25.5■■□□□ 1.67
CITED1-201ENST00000246139 ATRNL1Q5VV63 1379 aa25.49■■□□□ 1.67
CITED1-201ENST00000246139 IDH1O75874 414 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CITED1-201ENST00000246139 SLURP2P0DP57 97 aa25.49■■□□□ 1.67
CITED1-201ENST00000246139 SCYL3Q8IZE3 742 aa25.49■■□□□ 1.67
CITED1-201ENST00000246139 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CITED1-201ENST00000246139 PLCG2P16885 1265 aa25.48■■□□□ 1.67
CITED1-201ENST00000246139 MAP3K10Q02779 954 aa25.48■■□□□ 1.67
CITED1-201ENST00000246139 ADGRA1Q86SQ6 560 aa25.48■■□□□ 1.67
CITED1-201ENST00000246139 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
CITED1-201ENST00000246139 ANTXR1Q9H6X2 564 aa25.48■■□□□ 1.67
CITED1-201ENST00000246139 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP25.48■■□□□ 1.67
CITED1-201ENST00000246139 ZHX2Q9Y6X8 837 aa25.48■■□□□ 1.67
CITED1-201ENST00000246139 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa25.48■■□□□ 1.67
CITED1-201ENST00000246139 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
CITED1-201ENST00000246139 PPP4CP60510 307 aa25.47■■□□□ 1.67
CITED1-201ENST00000246139 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
CITED1-201ENST00000246139 KCNH4Q9UQ05 1017 aa25.47■■□□□ 1.67
CITED1-201ENST00000246139 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
CITED1-201ENST00000246139 CYP7A1P22680 504 aa25.46■■□□□ 1.67
CITED1-201ENST00000246139 ARMC5Q96C12 935 aa25.46■■□□□ 1.67
CITED1-201ENST00000246139 FAM196BA6NMK8 535 aa25.45■■□□□ 1.66
CITED1-201ENST00000246139 CXCL11O14625 94 aa25.45■■□□□ 1.66
CITED1-201ENST00000246139 TBC1D12O60347 775 aa25.45■■□□□ 1.66
CITED1-201ENST00000246139 PTPRAP18433 802 aa25.45■■□□□ 1.66
CITED1-201ENST00000246139 ARHGEF6Q15052 776 aa25.45■■□□□ 1.66
CITED1-201ENST00000246139 ANKRD23Q86SG2 305 aa25.45■■□□□ 1.66
CITED1-201ENST00000246139 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms