RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 DEFA1P59665 94 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRS-208ENST00000590509 RASL11AQ6T310 242 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRS-208ENST00000590509 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRS-208ENST00000590509 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRS-208ENST00000590509 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRS-208ENST00000590509 UBE2L6O14933 153 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRS-208ENST00000590509 PTTG1IPP53801 180 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRS-208ENST00000590509 Q6ZNX1 250 aa9.68□□□□□ -0.86
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PTPRS-208ENST00000590509 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
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PTPRS-208ENST00000590509 NIT2Q9NQR4 276 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRS-208ENST00000590509 XCL1P47992 114 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRS-208ENST00000590509 GAGE2BQ13066 116 aa9.66□□□□□ -0.86
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PTPRS-208ENST00000590509 ZNF664Q8N3J9 261 aa9.66□□□□□ -0.86
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PTPRS-208ENST00000590509 CACNG7P62955 275 aa9.65□□□□□ -0.86
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PTPRS-208ENST00000590509 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRS-208ENST00000590509 A0A1B0GV50 99 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRS-208ENST00000590509 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRS-208ENST00000590509 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRS-208ENST00000590509 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRS-208ENST00000590509 CCL25O15444 150 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRS-208ENST00000590509 MT-ND6P03923 174 aa9.63□□□□□ -0.87
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PTPRS-208ENST00000590509 SYCNQ0VAF6 134 aa9.63□□□□□ -0.87
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PTPRS-208ENST00000590509 TCEAL7Q9BRU2 100 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRS-208ENST00000590509 CYTL1Q9NRR1 136 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRS-208ENST00000590509 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRS-208ENST00000590509 FGF6P10767 208 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRS-208ENST00000590509 GATD1Q8NB37 220 aa9.62□□□□□ -0.87
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PTPRS-208ENST00000590509 A0A0U1RQV1 116 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRS-208ENST00000590509 IGLV7-43P04211 117 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRS-208ENST00000590509 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRS-208ENST00000590509 LYZL1Q6UWQ5 148 aa9.6□□□□□ -0.87
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PTPRS-208ENST00000590509 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa9.59□□□□□ -0.87
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PTPRS-208ENST00000590509 RPL35P42766 123 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
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PTPRS-208ENST00000590509 MED28Q9H204 178 aa9.58□□□□□ -0.88
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PTPRS-208ENST00000590509 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRS-208ENST00000590509 FAM168BA1KXE4 195 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRS-208ENST00000590509 SFT2D1Q8WV19 159 aa9.56□□□□□ -0.88
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PTPRS-208ENST00000590509 TRGC1P0CF51 173 aa9.54□□□□□ -0.88
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PTPRS-208ENST00000590509 H7C423 109 aa9.52□□□□□ -0.89
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PTPRS-208ENST00000590509 ESDP10768 282 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRS-208ENST00000590509 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa9.51□□□□□ -0.89
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PTPRS-208ENST00000590509 F2Z2F3 143 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRS-208ENST00000590509 PFDN1O60925 122 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRS-208ENST00000590509 TSPAN13O95857 204 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRS-208ENST00000590509 TSHBP01222 138 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRS-208ENST00000590509 CTRLP40313 264 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRS-208ENST00000590509 RPS20P60866 119 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
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