RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553686.5

ATXN3-223, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 869 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-223	ENST00000553686	IGLV7-43	P04211	117 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	CD3D	P04234	171 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	TYMS	P04818	313 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	BTC	P35070	178 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	RAB2A	P61019	212 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686		Q5BKY6	102 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	SLC25A6	P12236	298 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	S100A10	P60903	97 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	PFDN5	Q99471	154 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	NUDT15	Q9NV35	164 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686		Q9UF83	564 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	SSNA1	O43805	119 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	NDUFB6	O95139	128 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	RAB3D	O95716	219 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	CAV2	P51636	162 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	RBX1	P62877	108 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	REG3A	Q06141	175 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	SLC51B	Q86UW2	128 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	USH2A	O75445	5202 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686		H3BP45	60 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686		L7N2F9	121 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	S100A11	P31949	105 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	TAS2R19	P59542	299 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	UBE2D3	P61077	147 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	UBE2D2	P62837	147 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	MT1H	P80294	61 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	TSKU	Q8WUA8	353 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	PRO0461	Q9UI25	63 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	DISC1	C4P0D8	188 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686		M0R2T5	61 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	AKAIN1	P0CW23	69 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	CAMLG	P49069	296 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	RAB5C	P51148	216 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	ZNF345	Q14585	488 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	UQCC3	Q6UW78	93 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	COMMD7	Q86VX2	200 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	GGACT	Q9BVM4	153 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	TEX46	H3BTG2	121 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	TSC22D2	O75157	780 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	MPC2	O95563	127 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	PYY	P10082	97 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	HERV-K104	P63124	156 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	CTAG1A	P78358	180 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	C15orf56	Q8N910	161 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	PRRT1	Q99946	306 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	NMES1	Q9C002	83 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	TREM1	Q9NP99	234 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-223	ENST00000553686		A0A1W2PNN7	141 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-223	ENST00000553686	RAB19	A4D1S5	217 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-223	ENST00000553686		G3V3Q6	166 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-223	ENST00000553686	SMLR1	H3BR10	107 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-223	ENST00000553686	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-223	ENST00000553686	SULT1A2	P50226	295 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-223	ENST00000553686	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-223	ENST00000553686	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-223	ENST00000553686	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-223	ENST00000553686	MITD1	Q8WV92	249 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-223	ENST00000553686	SMIM8	Q96KF7	97 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-223	ENST00000553686	MGST2	Q99735	147 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-223	ENST00000553686	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-223	ENST00000553686	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88

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