RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CS-222	ENST00000550996	CRP	P02741	224 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-222	ENST00000550996	HAMP	P81172	84 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-222	ENST00000550996	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-222	ENST00000550996	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-222	ENST00000550996	FRZB	Q92765	325 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-222	ENST00000550996	TMEM243	Q9BU79	118 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-222	ENST00000550996		A0A1B0GUT8	65 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-222	ENST00000550996	FAM231B	A6NCW3	169 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-222	ENST00000550996	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-222	ENST00000550996	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-222	ENST00000550996	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-222	ENST00000550996	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-222	ENST00000550996	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-222	ENST00000550996	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-222	ENST00000550996	PEA15	Q15121	130 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-222	ENST00000550996	ADIRF	Q15847	76 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-222	ENST00000550996	RNF185	Q96GF1	192 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-222	ENST00000550996	NAT8	Q9UHE5	227 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-222	ENST00000550996	COTL1	Q14019	142 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-222	ENST00000550996	MIA	Q16674	131 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-222	ENST00000550996	NUP35	Q8NFH5	326 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-222	ENST00000550996	AMT	P48728	403 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-222	ENST00000550996	BORCS7	Q96B45	105 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-222	ENST00000550996	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-222	ENST00000550996	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-222	ENST00000550996	LINC01620	Q4KN68	170 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CS-222	ENST00000550996	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CS-222	ENST00000550996		A0A1B0GUV1	79 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-222	ENST00000550996	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-222	ENST00000550996	AMN1	Q8IY45	258 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-222	ENST00000550996	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-222	ENST00000550996	RAB4A	P20338	218 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-222	ENST00000550996	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CS-222	ENST00000550996	REG3A	Q06141	175 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-222	ENST00000550996	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-222	ENST00000550996	HLA-DQA1	P01909	254 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-222	ENST00000550996		Q6ZSA8	131 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-222	ENST00000550996	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-222	ENST00000550996	USP17L23	D6RBM5	183 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-222	ENST00000550996	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-222	ENST00000550996	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CS-222	ENST00000550996	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CS-222	ENST00000550996	UBE2L6	O14933	153 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-222	ENST00000550996	NCR2	O95944	276 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-222	ENST00000550996	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CS-222	ENST00000550996	RIG	Q13278	110 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CS-222	ENST00000550996	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CS-222	ENST00000550996	SMKR1	H3BMG3	65 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CS-222	ENST00000550996	EPM2A	B3EWF7	344 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-222	ENST00000550996	TSHB	P01222	138 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-222	ENST00000550996	APCS	P02743	223 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-222	ENST00000550996	PRSS1	P07477	247 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-222	ENST00000550996	MRAP2	Q96G30	205 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-222	ENST00000550996		I3L3M4	83 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-222	ENST00000550996	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CS-222	ENST00000550996	ST20	Q9HBF5	79 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-222	ENST00000550996	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-222	ENST00000550996	PMCH	P20382	165 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-222	ENST00000550996	C14orf177	Q52M58	125 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-222	ENST00000550996		Q5VSD8	79 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-222	ENST00000550996	NRAC	Q8N912	160 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-222	ENST00000550996	MYCBP2	O75592	4640 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-222	ENST00000550996	ESD	P10768	282 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-222	ENST00000550996	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-222	ENST00000550996	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-222	ENST00000550996	FGF6	P10767	208 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-222	ENST00000550996	CAMP	P49913	170 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-222	ENST00000550996	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CS-222	ENST00000550996	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-222	ENST00000550996		H7C423	109 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-222	ENST00000550996	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-222	ENST00000550996		A0A1B0GXF2	115 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-222	ENST00000550996	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-222	ENST00000550996	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CS-222	ENST00000550996	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CS-222	ENST00000550996	RAB14	P61106	215 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-222	ENST00000550996	IFITM2	Q01629	132 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-222	ENST00000550996	CLLU1	Q5K131	121 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-222	ENST00000550996	SCX	Q7RTU7	201 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-222	ENST00000550996	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CS-222	ENST00000550996		A0A1B0GW15	77 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-222	ENST00000550996	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CS-222	ENST00000550996	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-222	ENST00000550996	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CS-222	ENST00000550996	HBB	P68871	147 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-222	ENST00000550996	VCY	O14598	125 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-222	ENST00000550996	SLPI	P03973	132 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-222	ENST00000550996	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CS-222	ENST00000550996	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-222	ENST00000550996	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-222	ENST00000550996	PPP1R17	O96001	155 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-222	ENST00000550996	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-222	ENST00000550996	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CS-222	ENST00000550996	C15orf56	Q8N910	161 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-222	ENST00000550996	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-222	ENST00000550996	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-222	ENST00000550996	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CS-222	ENST00000550996	HERC1	Q15751	4861 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-222	ENST00000550996	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		13.45	□□□□□ -0.26

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