RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 A8MWL6 223 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 LECT2O14960 151 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 CRPP02741 224 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 TWIST1Q15672 202 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 C14orf177Q52M58 125 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 FAM210AQ96ND0 272 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 FAM231BA6NCW3 169 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 GATCO43716 136 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 RAB14P61106 215 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 GAGE6Q13070 117 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 SCXQ7RTU7 201 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 LINC01551Q86U37 167 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 GATD1Q8NB37 220 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 SMIM7Q9BQ49 75 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 TMEM243Q9BU79 118 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 SRP19P09132 144 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 OSTCQ9NRP0 149 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 NCR2O95944 276 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 REG3AQ06141 175 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 COTL1Q14019 142 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 TSKUQ8WUA8 353 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 ZNF727A8MUV8 499 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 USP17L23D6RBM5 183 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 IFITM2Q01629 132 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 FAM74A3Q4VXF1 159 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-221ENST00000550734 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 A0A1B0GUT8 65 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 HIGD1CA8MV81 97 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 H7C423 109 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 PRSS1P07477 247 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 AMTP48728 403 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 CEBPGP53567 150 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 SMDT1Q9H4I9 107 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 TNXBP22105 4242 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 HLA-DQA1P01909 254 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 TMEM241Q24JQ0 296 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 LINC01620Q4KN68 170 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 BORCS7Q96B45 105 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 V9GYV3 84 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 RNF213Q63HN8 5207 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 UBE2L6O14933 153 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 ISOC2Q96AB3 205 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 CLLU1Q5K131 121 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 MRAP2Q96G30 205 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 RNF185Q96GF1 192 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 LRP2P98164 4655 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 C9JQL5 133 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 I3L3M4 83 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 ESDP10768 282 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 RAB4AP20338 218 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 NUP35Q8NFH5 326 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 NAT8Q9UHE5 227 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 APCSP02743 223 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 FGF6P10767 208 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 RIGQ13278 110 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 PEA15Q15121 130 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 ST20Q9HBF5 79 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 GAS8-AS1O95177 125 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 PPP1R17O96001 155 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 TSHBP01222 138 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 PMCHP20382 165 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CS-221ENST00000550734 RPS10P46783 165 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 AMN1Q8IY45 258 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 A0A1B0GW15 77 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.7 ms