RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545223.1

PRKAB1-208, Transcript of protein kinase AMP-activated non-catalytic subunit beta 1, human

TSL 2

Gene PRKAB1, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKAB1-208	ENST00000545223	MT-ND6	P03923	174 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	PMCH	P20382	165 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	CCL18	P55774	89 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223		I3L3M4	83 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	VCY	O14598	125 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	LELP1	Q5T871	98 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	C20orf78	Q9BR46	151 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	PPP1R17	O96001	155 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	GAGE6	Q13070	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	COTL1	Q14019	142 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223		Q9H8V8	135 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223		M0R2N4	97 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	IGHV3-30	P01768	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	IGHV3-33	P01772	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	ESD	P10768	282 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	AMT	P48728	403 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	TIRAP	P58753	221 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	NIT1	Q86X76	327 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223		Q8N8P6	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223		Q8N976	141 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	LCE6A	A0A183	80 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	TMEM262	E9PQX1	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	SIVA1	O15304	175 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	NUPR1	O60356	82 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	FCER1G	P30273	86 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	MPV17L2	Q567V2	206 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	KIR2DL4	Q99706	377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRKAB1-208	ENST00000545223	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	LINC00310	P59036	64 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	TMEM243	Q9BU79	118 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223		A0A096LNJ9	63 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	LINC01546	A6NGU7	62 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	HIST1H2BK	O60814	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	LINC00614	P0C842	121 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	FGF6	P10767	208 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	HIST1H2BO	P23527	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	HIST1H2BB	P33778	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	HIST1H2BD	P58876	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	HIST1H2BC	P62807	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	RBX1	P62877	108 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	LAGE3	Q14657	143 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	FAM104A	Q969W3	186 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223		A0A087WX48	190 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	UBE2L6	O14933	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223		Q0VG73	95 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223		Q6ZR54	194 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	FA2H	Q7L5A8	372 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	KLK12	Q9UKR0	248 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKAB1-208	ENST00000545223	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89 ms