RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777		P01737	135 aa		10.33	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	MGP	P08493	103 aa		10.33	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		10.33	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	LINC00862	A6NCI5	91 aa		10.32	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	IGLC6	P0CF74	106 aa		10.32	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	ADCYAP1	P18509	176 aa		10.32	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		10.32	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	ISOC2	Q96AB3	205 aa		10.32	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	TPPP3	Q9BW30	176 aa		10.32	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	NAT8	Q9UHE5	227 aa		10.32	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		10.31	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777		H7C1H1	209 aa		10.31	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777		M0QY20	66 aa		10.31	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	REG3A	Q06141	175 aa		10.31	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	ADIRF	Q15847	76 aa		10.31	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		10.31	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		10.31	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		10.31	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		10.31	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		10.31	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		10.3	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	PANO1	I0J062	215 aa		10.3	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		10.3	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	GTSF1	Q8WW33	167 aa		10.3	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	CACNG7	P62955	275 aa		10.29	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		10.29	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	BIN3	Q9NQY0	253 aa		10.29	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		10.29	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		10.29	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		10.28	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		10.28	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM243	Q9BU79	118 aa		10.28	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	OSTC	Q9NRP0	149 aa		10.28	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777		V9GYV3	84 aa		10.28	□□□□□ -0.76
DDX11-222	ENST00000542777	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		10.27	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777		A0A1B0GUV1	79 aa		10.27	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777	hDV102S1	A0JD36	115 aa		10.27	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM218	A2RU14	115 aa		10.27	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777	RASL11A	Q6T310	242 aa		10.27	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777	UQCC3	Q6UW78	93 aa		10.27	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777		F2Z2F3	143 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777	CTRL	P40313	264 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777	DPH3	Q96FX2	82 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777	XKRY2	A2RUG3	117 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777	TRGC1	P0CF51	173 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777	NIT2	Q9NQR4	276 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777	UBE2L6	O14933	153 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777	NTF3	P20783	257 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777	CT83	Q5H943	113 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777	SLPI	P03973	132 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777	COTL1	Q14019	142 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777		A8MWL6	223 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777		F8W036	122 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777	AMT	P48728	403 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777	WDR73	Q6P4I2	378 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777		Q6ZRU5	148 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777	TSKU	Q8WUA8	353 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777	CNFN	Q9BYD5	112 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777		A0A087WYN8	130 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777	RNF185	Q96GF1	192 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDX11-222	ENST00000542777	HIGD1C	A8MV81	97 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDX11-222	ENST00000542777	CHTF8	P0CG12	524 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDX11-222	ENST00000542777	MT1HL1	P0DM35	61 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDX11-222	ENST00000542777	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDX11-222	ENST00000542777	NUP35	Q8NFH5	326 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDX11-222	ENST00000542777	SEC11C	Q9BY50	192 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDX11-222	ENST00000542777	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDX11-222	ENST00000542777	TWIST1	Q15672	202 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDX11-222	ENST00000542777	CFAP161	Q6P656	301 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDX11-222	ENST00000542777	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDX11-222	ENST00000542777	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DDX11-222	ENST00000542777	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DDX11-222	ENST00000542777	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
DDX11-222	ENST00000542777	C15orf56	Q8N910	161 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DDX11-222	ENST00000542777	GATD1	Q8NB37	220 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DDX11-222	ENST00000542777	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
DDX11-222	ENST00000542777	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DDX11-222	ENST00000542777	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDX11-222	ENST00000542777	FAM231B	A6NCW3	169 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDX11-222	ENST00000542777	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
DDX11-222	ENST00000542777	COX6A2	Q02221	97 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDX11-222	ENST00000542777	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDX11-222	ENST00000542777	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDX11-222	ENST00000542777		A0A1B0GUT8	65 aa		10.15	□□□□□ -0.78

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