RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 BTF3P20290 206 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
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PTPRK-218ENST00000525459 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-218ENST00000525459 NIT1Q86X76 327 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-218ENST00000525459 CHCHD5Q9BSY4 110 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-218ENST00000525459 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRK-218ENST00000525459 ATP6V1G1O75348 118 aa12.74□□□□□ -0.37
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PTPRK-218ENST00000525459 A0A087WX48 190 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRK-218ENST00000525459 H7C423 109 aa12.74□□□□□ -0.37
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PTPRK-218ENST00000525459 DNAH1Q9P2D7 4330 aa12.69□□□□□ -0.38
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PTPRK-218ENST00000525459 M0R2N4 97 aa12.68□□□□□ -0.38
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PTPRK-218ENST00000525459 C18orf32Q8TCD1 76 aa12.62□□□□□ -0.39
PTPRK-218ENST00000525459 TIMM21Q9BVV7 248 aa12.62□□□□□ -0.39
PTPRK-218ENST00000525459 LINC01549A6NIU2 74 aa12.61□□□□□ -0.39
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PTPRK-218ENST00000525459 LINC01546A6NGU7 62 aa12.6□□□□□ -0.39
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PTPRK-218ENST00000525459 C2orf66Q6UXQ4 117 aa12.57□□□□□ -0.4
PTPRK-218ENST00000525459 LINC00269Q8N2A0 174 aa12.57□□□□□ -0.4
PTPRK-218ENST00000525459 Q9HAA7 133 aa12.57□□□□□ -0.4
PTPRK-218ENST00000525459 NPSP0C0P6 89 aa12.56□□□□□ -0.4
PTPRK-218ENST00000525459 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa12.56□□□□□ -0.4
PTPRK-218ENST00000525459 RYR2Q92736 4967 aa12.55□□□□□ -0.4
PTPRK-218ENST00000525459 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa12.55□□□□□ -0.4
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