RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513274.5

COPB2-211, Transcript of coatomer protein complex subunit beta 2, humanhuman

TSL 3

Gene COPB2, Length 729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2-211ENST00000513274 BCL2P10415 239 aa7.31□□□□□ -1.24
COPB2-211ENST00000513274 CEBPGP53567 150 aa7.31□□□□□ -1.24
COPB2-211ENST00000513274 RASL11AQ6T310 242 aa7.31□□□□□ -1.24
COPB2-211ENST00000513274 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.31□□□□□ -1.24
COPB2-211ENST00000513274 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.31□□□□□ -1.24
COPB2-211ENST00000513274 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.31□□□□□ -1.24
COPB2-211ENST00000513274 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.3□□□□□ -1.24
COPB2-211ENST00000513274 C19orf71A6NCJ1 209 aa7.3□□□□□ -1.24
COPB2-211ENST00000513274 UBE2L6O14933 153 aa7.3□□□□□ -1.24
COPB2-211ENST00000513274 P01737 135 aa7.3□□□□□ -1.24
COPB2-211ENST00000513274 NTF3P20783 257 aa7.3□□□□□ -1.24
COPB2-211ENST00000513274 RPS20P60866 119 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
COPB2-211ENST00000513274 CACNG7P62955 275 aa7.3□□□□□ -1.24
COPB2-211ENST00000513274 ALKAL2Q6UX46 152 aa7.3□□□□□ -1.24
COPB2-211ENST00000513274 A0A087WYN8 130 aa7.29□□□□□ -1.24
COPB2-211ENST00000513274 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.29□□□□□ -1.24
COPB2-211ENST00000513274 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.29□□□□□ -1.24
COPB2-211ENST00000513274 AMTP48728 403 aa7.29□□□□□ -1.24
COPB2-211ENST00000513274 C11orf52Q96A22 123 aa7.29□□□□□ -1.24
COPB2-211ENST00000513274 SMIM12Q96EX1 92 aa7.29□□□□□ -1.24
COPB2-211ENST00000513274 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
COPB2-211ENST00000513274 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.29□□□□□ -1.24
COPB2-211ENST00000513274 NIT2Q9NQR4 276 aa7.29□□□□□ -1.24
COPB2-211ENST00000513274 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
COPB2-211ENST00000513274 A0A1B0GUV1 79 aa7.28□□□□□ -1.24
COPB2-211ENST00000513274 TRGC1P0CF51 173 aa7.28□□□□□ -1.24
COPB2-211ENST00000513274 MT1HL1P0DM35 61 aa7.28□□□□□ -1.24
COPB2-211ENST00000513274 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
COPB2-211ENST00000513274 TWIST1Q15672 202 aa7.28□□□□□ -1.24
COPB2-211ENST00000513274 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.28□□□□□ -1.24
COPB2-211ENST00000513274 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.27□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 F2Z2F3 143 aa7.27□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 COTL1Q14019 142 aa7.27□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 WDR73Q6P4I2 378 aa7.27□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 NUDT10Q8NFP7 164 aa7.27□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 NUDT11Q96G61 164 aa7.27□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.27□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.27□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 TNXBP22105 4242 aa7.26□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.26□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.26□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 PHOX2AO14813 284 aa7.26□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 COX6A2Q02221 97 aa7.26□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 Q6ZRU5 148 aa7.26□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.26□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 C15orf56Q8N910 161 aa7.26□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 GATD1Q8NB37 220 aa7.26□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 MAJINQ3KP22 176 aa7.25□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa7.25□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 LYPD6BQ8NI32 183 aa7.25□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.25□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 GTSF1Q8WW33 167 aa7.25□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 BORCS7Q96B45 105 aa7.25□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
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COPB2-211ENST00000513274 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 ODF1Q14990 250 aa7.24□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.24□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 TMEM250H0YL14 139 aa7.23□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 RPS10P46783 165 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 CFAP161Q6P656 301 aa7.23□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 C7orf33Q8WU49 177 aa7.23□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 RNF185Q96GF1 192 aa7.23□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.23□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 K7EN84 100 aa7.22□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 CTRLP40313 264 aa7.22□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 STPG4Q8N801 248 aa7.22□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 OCC1Q8TAD7 63 aa7.22□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.22□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 SMIM7Q9BQ49 75 aa7.22□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
COPB2-211ENST00000513274 GATCO43716 136 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 APCSP02743 223 aa7.21□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.2□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 ZNF727A8MUV8 499 aa7.2□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 FGF6P10767 208 aa7.2□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 PMCHP20382 165 aa7.2□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 XCL1P47992 114 aa7.2□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 A0A096LNI7 61 aa7.19□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 A8MWL6 223 aa7.19□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 GAS8-AS1O95177 125 aa7.19□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 FOXI1Q12951 378 aa7.19□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 CCL25O15444 150 aa7.18□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 NCR2O95944 276 aa7.18□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 RAB14P61106 215 aa7.18□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 PEA15Q15121 130 aa7.18□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 TMEM101Q96IK0 257 aa7.18□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 FAM210AQ96ND0 272 aa7.18□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 CNFNQ9BYD5 112 aa7.18□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 LRP2P98164 4655 aa7.18□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 FAM231BA6NCW3 169 aa7.17□□□□□ -1.26
COPB2-211ENST00000513274 I3L3M4 83 aa7.17□□□□□ -1.26
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