RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GINS2Q9Y248 185 aa-0.67□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MYO7BQ6PIF6 2116 aa-0.67□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRRC37A2A6NM11 1700 aa-0.68□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TNFP01375 233 aa-0.68□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IL5P05113 134 aa-0.68□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCL8P80075 99 aa-0.68□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TAC4Q86UU9 113 aa-0.68□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPTSSAQ969W0 71 aa-0.68□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AQP10Q96PS8 301 aa-0.68□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GSKIPQ9P0R6 139 aa-0.68□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DNAJC13O75165 2243 aa-0.68□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KDM3BQ7LBC6 1761 aa-0.68□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HERC1Q15751 4861 aa-0.68□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa-0.69□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NDUFB6O95139 128 aa-0.69□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-0.69□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ERCC6Q03468 1493 aa-0.69□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PXDNQ92626 1479 aa-0.69□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IFT172Q9UG01 1749 aa-0.69□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM2Q9UHN6 1383 aa-0.7□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa-0.7□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DISP2A7MBM2 1401 aa-0.7□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OVOS2Q6IE36 1432 aa-0.7□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRP1BQ9NZR2 4599 aa-0.7□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 M0R2T5 61 aa-0.7□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NCR2O95944 276 aa-0.7□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPP1R17O96001 155 aa-0.7□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 APOC3P02656 99 aa-0.7□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FABP1P07148 127 aa-0.7□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCL18P55774 89 aa-0.7□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBE2G1P62253 170 aa-0.7□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MORN2Q502X0 79 aa-0.7□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM170BQ5T4T1 132 aa-0.7□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPTSSBQ8NFR3 76 aa-0.7□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C10orf82Q8WW14 230 aa-0.7□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LINC00312Q9Y6C7 94 aa-0.7□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 M0R135 149 aa-0.71□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TPPP2P59282 170 aa-0.71□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SDF2Q99470 211 aa-0.71□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FXYD6Q9H0Q3 95 aa-0.71□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARHGEF10O15013 1369 aa-0.71□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPRR1BP22528 89 aa-0.72□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 B2MP61769 119 aa-0.72□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MIC13Q5XKP0 118 aa-0.72□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SELENOSQ9BQE4 189 aa-0.72□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AIF1LQ9BQI0 150 aa-0.72□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SEC11CQ9BY50 192 aa-0.72□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LENEPQ9Y5L5 61 aa-0.72□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRP6O75581 1613 aa-0.72□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCNX1Q96RV3 2341 aa-0.72□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SHANK2Q9UPX8 1470 aa-0.73□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa-0.73□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLPSL1A2RUU4 121 aa-0.73□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 I3L2K1 104 aa-0.73□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SIX6O95475 246 aa-0.73□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NEFHP12036 1026 aa-0.73□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPRR2AP35326 72 aa-0.73□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ALX1Q15699 326 aa-0.73□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 Q6JHZ5 121 aa-0.73□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COPS9Q8WXC6 57 aa-0.73□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 V9GYH0 126 aa-0.73□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLXNB2O15031 1838 aa-0.73□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IQSEC2Q5JU85 1478 aa-0.73□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PI4KAP42356 2102 aa-0.74□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LAMA5O15230 3695 aa-0.74□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UQCR11O14957 56 aa-0.74□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COX8AP10176 69 aa-0.74□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 S100A5P33763 92 aa-0.74□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 Q6ZUT4 128 aa-0.74□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNRGQ8N5I3 272 aa-0.74□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TCEAL4Q96EI5 215 aa-0.74□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IFT140Q96RY7 1462 aa-0.74□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PBRM1Q86U86 1689 aa-0.75□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa-0.75□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 M0R2Z0 102 aa-0.75□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IFNGP01579 166 aa-0.75□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DEFB123Q8N688 67 aa-0.75□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EPG5Q9HCE0 2579 aa-0.75□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TSC2P49815 1807 aa-0.75□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PKHD1P08F94 4074 aa-0.76□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HIVEP1P15822 2718 aa-0.76□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa-0.76□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C10orf128Q5T292 105 aa-0.76□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C12orf73Q69YU5 71 aa-0.76□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BAGE2Q86Y30 109 aa-0.76□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 USMG5Q96IX5 58 aa-0.76□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GAPVD1Q14C86 1478 aa-0.76□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa-0.76□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PAPPAQ13219 1627 aa-0.76□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NWD2Q9ULI1 1742 aa-0.76□□□□□ -2.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MYH13Q9UKX3 1938 aa-0.76□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms