RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 C2CD3Q4AC94 2353 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 H7C2G1 150 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 CFAP126Q5VTH2 177 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 Q6ZUT4 128 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 C4orf3Q8WVX3 66 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 CARD19Q96LW7 228 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 NOTCH2Q04721 2471 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 TSPAN13O95857 204 aa9.42□□□□□ -0.9
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PRAME-213ENST00000492657 FAM231CP0DMU5 169 aa9.42□□□□□ -0.9
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PRAME-213ENST00000492657 DYNLRB2Q8TF09 96 aa9.42□□□□□ -0.9
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PRAME-213ENST00000492657 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa9.39□□□□□ -0.91
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PRAME-213ENST00000492657 A0A0J9YY99 117 aa9.35□□□□□ -0.91
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PRAME-213ENST00000492657 C20orf203Q8NBC4 194 aa9.35□□□□□ -0.91
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PRAME-213ENST00000492657 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 CCL24O00175 119 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 CRLF1O75462 422 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 UBE2D1P51668 147 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 RHOHQ15669 191 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 C3orf56Q8N813 242 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 NDUFA11Q86Y39 141 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 C11orf72Q8NBR9 251 aa9.33□□□□□ -0.92
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PRAME-213ENST00000492657 CFC1P0CG37 223 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 TEN1Q86WV5 123 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 HIVEP2P31629 2446 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 C9JAW5 83 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 ZNF415Q09FC8 603 aa9.32□□□□□ -0.92
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PRAME-213ENST00000492657 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 TRAV4A0A0B4J268 109 aa9.32□□□□□ -0.92
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PRAME-213ENST00000492657 PPDPFLQ8WWR9 84 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 FAM104AQ969W3 186 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 A8MWV9 139 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 INSP01308 110 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 UBE2D3P61077 147 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 UBE2D2P62837 147 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 LINC01006Q8NI28 216 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 SLC25A29Q8N8R3 303 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 IGHV3-30P01768 117 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa9.3□□□□□ -0.92
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