RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SSR4-208	ENST00000471880	ENHO	Q6UWT2	76 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SSR4-208	ENST00000471880	ISOC2	Q96AB3	205 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SSR4-208	ENST00000471880	RAB14	P61106	215 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SSR4-208	ENST00000471880	HAMP	P81172	84 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SSR4-208	ENST00000471880	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SSR4-208	ENST00000471880	RIG	Q13278	110 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SSR4-208	ENST00000471880		V9GYV3	84 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SSR4-208	ENST00000471880	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SSR4-208	ENST00000471880	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SSR4-208	ENST00000471880	PMCH	P20382	165 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SSR4-208	ENST00000471880	MIA	Q16674	131 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SSR4-208	ENST00000471880	NUP35	Q8NFH5	326 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SSR4-208	ENST00000471880	FRZB	Q92765	325 aa		9.78	□□□□□ -0.84
SSR4-208	ENST00000471880	FAM231B	A6NCW3	169 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880	APCS	P02743	223 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880	REG3A	Q06141	175 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880	AMN1	Q8IY45	258 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		9.77	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880	LINC01620	Q4KN68	170 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	9.76	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880		Q8N1X5	172 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880	ST20	Q9HBF5	79 aa		9.76	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	9.75	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	9.75	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880	NCR2	O95944	276 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880	CAMP	P49913	170 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880	C14orf177	Q52M58	125 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		9.75	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880	USP17L23	D6RBM5	183 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880	SMKR1	H3BMG3	65 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880		I3L3M4	83 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880	GAS8-AS1	O95177	125 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	9.74	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880	RAB4A	P20338	218 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880	XG	P55808	180 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880	EPM2A	B3EWF7	344 aa		9.73	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	9.73	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880	MRAP2	Q96G30	205 aa		9.73	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880	RNF185	Q96GF1	192 aa		9.73	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880	PRR34	Q9NV39	138 aa		9.73	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		9.73	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880	FAT1	Q14517	4588 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1B0GUV1	79 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SSR4-208	ENST00000471880	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880	FCER1G	P30273	86 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	9.71	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880	BTF3L4	Q96K17	158 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880	FGF6	P10767	208 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM101	Q96IK0	257 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		9.7	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880		Q5VSD8	79 aa		9.69	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880	TSHB	P01222	138 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880	S100A8	P05109	93 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880	CKS2	P33552	79 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	9.68	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1B0GW15	77 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880	hDV102S1	A0JD36	115 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880		F8W036	122 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880	FAM229A	H3BQW9	127 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880		H7C423	109 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880	PPP1R17	O96001	155 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880	PRSS1	P07477	247 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880	HBB	P68871	147 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880	VCY	O14598	125 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880	PPP1R2P9	O14990	202 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	9.66	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880	KIR2DL4	Q99706	377 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	9.65	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	9.65	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	9.65	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880	CLLU1	Q5K131	121 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		9.65	□□□□□ -0.86
SSR4-208	ENST00000471880	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		9.65	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880	MT-ND4L	P03901	98 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880	NRAC	Q8N912	160 aa		9.64	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	9.64	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880		D6R8Y8	96 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880	ESD	P10768	282 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880	XCL1	P47992	114 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		9.63	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00862	A6NCI5	91 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880	TNFRSF6B	O95407	300 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SSR4-208	ENST00000471880	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		9.62	□□□□□ -0.87

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