RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 INSP01308 110 aa14.89□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 C11orf44Q8N8P7 122 aa14.89□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 C11orf72Q8NBR9 251 aa14.89□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 FAM104AQ969W3 186 aa14.89□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa14.88□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 J3QR89 54 aa14.88□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 UBE2D3P61077 147 aa14.87□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 UBE2D2P62837 147 aa14.87□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 Q6ZSV7 163 aa14.87□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa14.87□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa14.87□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 A0A1W2PRX2 142 aa14.87□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 C10orf126Q8N4M7 172 aa14.87□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 XCL2Q9UBD3 114 aa14.87□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 CHCHD7Q9BUK0 85 aa14.86□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 TIMM21Q9BVV7 248 aa14.86□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 A4D1N5 150 aa14.85□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa14.85□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 LYRM7Q5U5X0 104 aa14.85□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 PRO1854Q9UHT4 67 aa14.85□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa14.85□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa14.85□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 PTH2Q96A98 100 aa14.84□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 TLN2Q9Y4G6 2542 aa14.84□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa14.84□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 ODF3L2Q3SX64 289 aa14.84□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa14.84□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 TMEM238C9JI98 176 aa14.83□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 IGHV3-53P01767 116 aa14.83□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 AZU1P20160 251 aa14.83□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 INSL3P51460 131 aa14.83□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 CRYBA4P53673 196 aa14.83□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 MUSTN1Q8IVN3 82 aa14.83□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 LINC00467Q9BRT7 94 aa14.83□□□□□ -0.03
IMP4-208ENST00000460766 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa14.83□□□□□ -0.04
IMP4-208ENST00000460766 STHQ8IWL8 128 aa14.83□□□□□ -0.04
IMP4-208ENST00000460766 TMEM86BQ8N661 226 aa14.83□□□□□ -0.04
IMP4-208ENST00000460766 SPANXA1Q9NS26 97 aa14.83□□□□□ -0.04
IMP4-208ENST00000460766 A0A0J9YXY3 114 aa14.82□□□□□ -0.04
IMP4-208ENST00000460766 TCL1BO95988 128 aa14.82□□□□□ -0.04
IMP4-208ENST00000460766 SCGB1C2P0DMR2 95 aa14.82□□□□□ -0.04
IMP4-208ENST00000460766 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
IMP4-208ENST00000460766 BEAN1Q3B7T3 259 aa14.82□□□□□ -0.04
IMP4-208ENST00000460766 WFDC11Q8NEX6 87 aa14.82□□□□□ -0.04
IMP4-208ENST00000460766 Q6ZUT4 128 aa14.81□□□□□ -0.04
IMP4-208ENST00000460766 DNAJC30Q96LL9 226 aa14.81□□□□□ -0.04
IMP4-208ENST00000460766 APCP25054 2843 aa14.8□□□□□ -0.04
IMP4-208ENST00000460766 EPG5Q9HCE0 2579 aa14.8□□□□□ -0.04
IMP4-208ENST00000460766 NACAE9PAV3 2078 aa14.8□□□□□ -0.04
IMP4-208ENST00000460766 RS1O15537 224 aa14.8□□□□□ -0.04
IMP4-208ENST00000460766 H7C2G1 150 aa14.8□□□□□ -0.04
IMP4-208ENST00000460766 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa14.79□□□□□ -0.04
IMP4-208ENST00000460766 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa14.79□□□□□ -0.04
IMP4-208ENST00000460766 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa14.79□□□□□ -0.04
IMP4-208ENST00000460766 GAGE12HA6NDE8 117 aa14.79□□□□□ -0.04
IMP4-208ENST00000460766 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
IMP4-208ENST00000460766 SONP18583 2426 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
IMP4-208ENST00000460766 CHD6Q8TD26 2715 aa14.79□□□□□ -0.04
IMP4-208ENST00000460766 AKAP9Q99996 3911 aa14.78□□□□□ -0.04
IMP4-208ENST00000460766 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa14.78□□□□□ -0.04
IMP4-208ENST00000460766 GTSF1LQ9H1H1 148 aa14.78□□□□□ -0.04
IMP4-208ENST00000460766 CCL24O00175 119 aa14.78□□□□□ -0.04
IMP4-208ENST00000460766 SPINK8P0C7L1 97 aa14.78□□□□□ -0.04
IMP4-208ENST00000460766 C1orf158Q8N1D5 194 aa14.78□□□□□ -0.04
IMP4-208ENST00000460766 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa14.77□□□□□ -0.04
IMP4-208ENST00000460766 A8MZ25 164 aa14.77□□□□□ -0.04
IMP4-208ENST00000460766 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
IMP4-208ENST00000460766 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
IMP4-208ENST00000460766 NDUFA12Q9UI09 145 aa14.77□□□□□ -0.05
IMP4-208ENST00000460766 TRAV25A0A0B4J276 109 aa14.76□□□□□ -0.05
IMP4-208ENST00000460766 IGHV3-33P01772 117 aa14.76□□□□□ -0.05
IMP4-208ENST00000460766 PRSS2P07478 247 aa14.76□□□□□ -0.05
IMP4-208ENST00000460766 VSIG2Q96IQ7 327 aa14.76□□□□□ -0.05
IMP4-208ENST00000460766 ESM1Q9NQ30 184 aa14.76□□□□□ -0.05
IMP4-208ENST00000460766 ERG28Q9UKR5 140 aa14.76□□□□□ -0.05
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IMP4-208ENST00000460766 A0A0B4J2C4 111 aa14.76□□□□□ -0.05
IMP4-208ENST00000460766 FOXI1Q12951 378 aa14.76□□□□□ -0.05
IMP4-208ENST00000460766 FHL3Q13643 280 aa14.76□□□□□ -0.05
IMP4-208ENST00000460766 CLUHP3Q96NS8 147 aa14.76□□□□□ -0.05
IMP4-208ENST00000460766 SIGMAR1Q99720 223 aa14.76□□□□□ -0.05
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IMP4-208ENST00000460766 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
IMP4-208ENST00000460766 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa14.75□□□□□ -0.05
IMP4-208ENST00000460766 LITAFQ99732 161 aa14.75□□□□□ -0.05
IMP4-208ENST00000460766 Q1RN00 199 aa14.74□□□□□ -0.05
IMP4-208ENST00000460766 TEX29Q8N6K0 151 aa14.74□□□□□ -0.05
IMP4-208ENST00000460766 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa14.74□□□□□ -0.05
IMP4-208ENST00000460766 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa14.74□□□□□ -0.05
IMP4-208ENST00000460766 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
IMP4-208ENST00000460766 SPATA25Q9BR10 227 aa14.73□□□□□ -0.05
IMP4-208ENST00000460766 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa14.73□□□□□ -0.05
IMP4-208ENST00000460766 SMAGPQ0VAQ4 97 aa14.72□□□□□ -0.05
IMP4-208ENST00000460766 NF1P21359 2839 aa14.72□□□□□ -0.05
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