RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-205ENST00000450873 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-205ENST00000450873 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1W2PPM0 123 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-205ENST00000450873 H3BUT2 72 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP5G1P05496 136 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-205ENST00000450873 RASL10AQ92737 203 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-205ENST00000450873 hDV102S1A0JD36 115 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGEF1-205ENST00000450873 C19orf71A6NCJ1 209 aa7.49□□□□□ -1.21
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RABGEF1-205ENST00000450873 HBBP68871 147 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGEF1-205ENST00000450873 CT83Q5H943 113 aa7.49□□□□□ -1.21
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RABGEF1-205ENST00000450873 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGEF1-205ENST00000450873 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGEF1-205ENST00000450873 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGEF1-205ENST00000450873 F8W1H4 67 aa7.49□□□□□ -1.21
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RABGEF1-205ENST00000450873 SIVA1O15304 175 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-205ENST00000450873 LINC01545Q5VT33 79 aa7.48□□□□□ -1.21
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RABGEF1-205ENST00000450873 ARMS2P0C7Q2 107 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-205ENST00000450873 MED14OSP0DP75 135 aa7.48□□□□□ -1.21
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RABGEF1-205ENST00000450873 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-205ENST00000450873 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.47□□□□□ -1.21
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RABGEF1-205ENST00000450873 GAGE6Q13070 117 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-205ENST00000450873 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
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RABGEF1-205ENST00000450873 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.46□□□□□ -1.22
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RABGEF1-205ENST00000450873 A8MWL6 223 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-205ENST00000450873 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-205ENST00000450873 ERG28Q9UKR5 140 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-205ENST00000450873 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-205ENST00000450873 SNAI2O43623 268 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-205ENST00000450873 LY6G6CO95867 125 aa7.45□□□□□ -1.22
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RABGEF1-205ENST00000450873 IGHV3-53P01767 116 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-205ENST00000450873 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-205ENST00000450873 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-205ENST00000450873 A8MWV9 139 aa7.44□□□□□ -1.22
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RABGEF1-205ENST00000450873 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-205ENST00000450873 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-205ENST00000450873 H3BNG1 76 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-205ENST00000450873 M0R381 172 aa7.43□□□□□ -1.22
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RABGEF1-205ENST00000450873 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
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RABGEF1-205ENST00000450873 SPINK8P0C7L1 97 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGEF1-205ENST00000450873 LGALS9CQ6DKI2 356 aa7.4□□□□□ -1.23
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RABGEF1-205ENST00000450873 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGEF1-205ENST00000450873 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGEF1-205ENST00000450873 JPT2Q9H910 190 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGEF1-205ENST00000450873 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-205ENST00000450873 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-205ENST00000450873 CRYGDP07320 174 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-205ENST00000450873 CNFNQ9BYD5 112 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A087WWL8 130 aa7.38□□□□□ -1.23
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