RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.16□□□□□ -1.26
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DNAH9Q9NYC9 4486 aa7.15□□□□□ -1.26
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C3orf84H3BNL1 204 aa7.15□□□□□ -1.26
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GAS8-AS1O95177 125 aa7.15□□□□□ -1.26
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BAGE3Q86Y29 109 aa7.15□□□□□ -1.26
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.15□□□□□ -1.26
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.14□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.14□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.14□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 K7EMI3 77 aa7.14□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LINC00694P0DN24 101 aa7.14□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CCL18P55774 89 aa7.14□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 Q8N8P6 123 aa7.14□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.14□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.13□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 UBE2L6O14933 153 aa7.13□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 G0S2P27469 103 aa7.13□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AMTP48728 403 aa7.13□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PKIAP61925 76 aa7.13□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.13□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.13□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa7.13□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM18Q96B42 140 aa7.13□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 Q9UF83 564 aa7.13□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.12□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TIRAPP58753 221 aa7.12□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IQCJQ1A5X6 159 aa7.12□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM243Q9BU79 118 aa7.12□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.12□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.11□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HIST1H2BKO60814 126 aa7.11□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HIST1H2BJP06899 126 aa7.11□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HIST1H2BOP23527 126 aa7.11□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HIST1H2BBP33778 126 aa7.11□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HIST1H2BDP58876 126 aa7.11□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HIST1H2BCP62807 126 aa7.11□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 Q0VG73 95 aa7.11□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LAGE3Q14657 143 aa7.11□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.11□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LELP1Q5T871 98 aa7.11□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.11□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.11□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.11□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.11□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 APLNQ9ULZ1 77 aa7.11□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LINC01549A6NIU2 74 aa7.1□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HSBP1O75506 76 aa7.1□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TSHBP01222 138 aa7.1□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 S100A6P06703 90 aa7.1□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LINC00614P0C842 121 aa7.1□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.1□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TGP01266 2768 aa7.1□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CASC10Q5T4H9 136 aa7.09□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.09□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NIT1Q86X76 327 aa7.09□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.09□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.08□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A087WX48 190 aa7.08□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM262E9PQX1 116 aa7.08□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 H7C423 109 aa7.08□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NDUFA6P56556 154 aa7.08□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ESRGQ1W209 222 aa7.08□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CYSLTR1Q9Y271 337 aa7.08□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SERF1AO75920 110 aa7.07□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HBDP02042 147 aa7.07□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.07□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.07□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM101Q96IK0 257 aa7.07□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LINC01546A6NGU7 62 aa7.06□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GAGE6Q13070 117 aa7.06□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.06□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.06□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.06□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.06□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.06□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SIVA1O15304 175 aa7.05□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ESDP10768 282 aa7.05□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.05□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LCE1DQ5T752 114 aa7.05□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 Q6ZN92 141 aa7.05□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.05□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 UPK3BQ9BT76 320 aa7.05□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.05□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa7.04□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FGF6P10767 208 aa7.04□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 S100A2P29034 98 aa7.04□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PMCHL1Q16048 86 aa7.04□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LGALS9CQ6DKI2 356 aa7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.6 ms