RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 PEA15Q15121 130 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 TWIST1Q15672 202 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 TMEM241Q24JQ0 296 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 TMEM97Q5BJF2 176 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 RASL11AQ6T310 242 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 NAT8Q9UHE5 227 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.05□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 MGPP08493 103 aa8.05□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 Q0VG73 95 aa8.05□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 IQCJQ1A5X6 159 aa8.05□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 ATRAIDQ6UW56 229 aa8.05□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.05□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 NIT2Q9NQR4 276 aa8.05□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 HMCN2Q8NDA2 5059 aa8.04□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 HIGD1CA8MV81 97 aa8.04□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 GATD1Q8NB37 220 aa8.04□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.04□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 A0A1B0GUT8 65 aa8.03□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 CRPP02741 224 aa8.03□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 C15orf54Q8N8G6 183 aa8.03□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.03□□□□□ -1.12
PRAME-204ENST00000403441 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa8.02□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 PKIAP61925 76 aa8.02□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 IFITM2Q01629 132 aa8.02□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 MPV17L2Q567V2 206 aa8.02□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 CLLU1Q5K131 121 aa8.02□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 NUP35Q8NFH5 326 aa8.02□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.01□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 TMEM262E9PQX1 116 aa8.01□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 ADIRFQ15847 76 aa8.01□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 PRR34Q9NV39 138 aa8.01□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 ENHOQ6UWT2 76 aa8□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 RNF185Q96GF1 192 aa8□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 NAT8BQ9UHF3 227 aa8□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 A0A1B0GUV1 79 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 USP17L23D6RBM5 183 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 HLA-DQA1P01909 254 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 ANGP03950 147 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 BORCS7Q96B45 105 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 RAB4AP20338 218 aa7.98□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 RAB14P61106 215 aa7.98□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 RBX1P62877 108 aa7.98□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 GAS8-AS1O95177 125 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 NCR2O95944 276 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 RIGQ13278 110 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 MIAQ16674 131 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 MRAP2Q96G30 205 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 TMEM243Q9BU79 118 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-204ENST00000403441 A0A1B0GW15 77 aa7.96□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 A0A1B0GXF2 115 aa7.96□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 GAGE6Q13070 117 aa7.96□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 COTL1Q14019 142 aa7.96□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 AMN1Q8IY45 258 aa7.96□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.96□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.95□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 PRSS1P07477 247 aa7.95□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 RPS10P46783 165 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.95□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 NRACQ8N912 160 aa7.95□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.94□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 H7C423 109 aa7.94□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 ESDP10768 282 aa7.94□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 UQCC3Q6UW78 93 aa7.94□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.94□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 I3L3M4 83 aa7.93□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 PPP1R2P9O14990 202 aa7.93□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 TSHBP01222 138 aa7.93□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 AMTP48728 403 aa7.93□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.93□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.93□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 LINC00862A6NCI5 91 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 ADCYAP1P18509 176 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 REG3AQ06141 175 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-204ENST00000403441 ST20Q9HBF5 79 aa7.92□□□□□ -1.14
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