RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 S100A9P06702 114 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PTPRF-216ENST00000617451 PRR34Q9NV39 138 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRF-216ENST00000617451 VAX2Q9UIW0 290 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM97Q5BJF2 176 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRF-216ENST00000617451 C9orf163Q8N9P6 203 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRF-216ENST00000617451 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRF-216ENST00000617451 MUC21A0A140T8X8 626 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRF-216ENST00000617451 F5H697 171 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRF-216ENST00000617451 ARPC5O15511 151 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRF-216ENST00000617451 OR5AL1P0C617 328 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRF-216ENST00000617451 SPANXN1Q5VSR9 72 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRF-216ENST00000617451 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRF-216ENST00000617451 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PTPRF-216ENST00000617451 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PTPRF-216ENST00000617451 RBX1P62877 108 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRF-216ENST00000617451 BAGE2Q86Y30 109 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRF-216ENST00000617451 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRF-216ENST00000617451 SCO2A0A1W2PP80 73 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRF-216ENST00000617451 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRF-216ENST00000617451 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PTPRF-216ENST00000617451 CLPSL2Q6UWE3 100 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRF-216ENST00000617451 LINC00269Q8N2A0 174 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRF-216ENST00000617451 SFT2D1Q8WV19 159 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRF-216ENST00000617451 MBD3L1Q8WWY6 194 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRF-216ENST00000617451 DERL1Q9BUN8 251 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRF-216ENST00000617451 SSTP61278 116 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRF-216ENST00000617451 GAGE6Q13070 117 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRF-216ENST00000617451 BATF3Q9NR55 127 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRF-216ENST00000617451 PANO1I0J062 215 aa16■□□□□ 0.15
PTPRF-216ENST00000617451 SDIM1Q6ZPB5 146 aa16■□□□□ 0.15
PTPRF-216ENST00000617451 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRF-216ENST00000617451 SMIM17P0DL12 118 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRF-216ENST00000617451 FAM213BQ8TBF2 198 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1B0GV50 99 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRF-216ENST00000617451 PFDN1O60925 122 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRF-216ENST00000617451 IQCJQ1A5X6 159 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRF-216ENST00000617451 CLRN3Q8NCR9 226 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRF-216ENST00000617451 AP1S3Q96PC3 154 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRF-216ENST00000617451 TMUB2Q71RG4 321 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRF-216ENST00000617451 UMAD1C9J7I0 102 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRF-216ENST00000617451 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-216ENST00000617451 M0QY20 66 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-216ENST00000617451 REG3AQ06141 175 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRF-216ENST00000617451 CNBPP62633 177 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-216ENST00000617451 KCNRGQ8N5I3 272 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRF-216ENST00000617451 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-216ENST00000617451 SMLR1H3BR10 107 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-216ENST00000617451 RPL35P42766 123 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-216ENST00000617451 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF345Q14585 488 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-216ENST00000617451 C20orf203Q8NBC4 194 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-216ENST00000617451 A0A0D9SG52 128 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-216ENST00000617451 MT1HL1P0DM35 61 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRF-216ENST00000617451 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRF-216ENST00000617451 hDV102S1A0JD36 115 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRF-216ENST00000617451 H7C1H1 209 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRF-216ENST00000617451 P01737 135 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRF-216ENST00000617451 MGPP08493 103 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRF-216ENST00000617451 H2AFB1P0C5Y9 115 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRF-216ENST00000617451 IGLC6P0CF74 106 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRF-216ENST00000617451 GZMBP10144 247 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRF-216ENST00000617451 SUMO4Q6EEV6 95 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1B0GUV1 79 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRF-216ENST00000617451 Q6ZRU5 148 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRF-216ENST00000617451 TPPP3Q9BW30 176 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRF-216ENST00000617451 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa15.88■□□□□ 0.13
PTPRF-216ENST00000617451 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa15.88■□□□□ 0.13
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM243Q9BU79 118 aa15.88■□□□□ 0.13
PTPRF-216ENST00000617451 SLPIP03973 132 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRF-216ENST00000617451 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PTPRF-216ENST00000617451 C11orf52Q96A22 123 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRF-216ENST00000617451 GFRA4Q9GZZ7 299 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRF-216ENST00000617451 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRF-216ENST00000617451 RPS20P60866 119 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PTPRF-216ENST00000617451 CACNG7P62955 275 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRF-216ENST00000617451 OR2D3Q8NGH3 330 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRF-216ENST00000617451 HMSDA8MTL9 139 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-216ENST00000617451 RGS21Q2M5E4 152 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-216ENST00000617451 CENPWQ5EE01 88 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-216ENST00000617451 RASL11AQ6T310 242 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-216ENST00000617451 RNF185Q96GF1 192 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-216ENST00000617451 AP5S1Q9NUS5 200 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-216ENST00000617451 TNXBP22105 4242 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRF-216ENST00000617451 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PTPRF-216ENST00000617451 C19orf71A6NCJ1 209 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRF-216ENST00000617451 RAB5CP51148 216 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRF-216ENST00000617451 CCL20P78556 96 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRF-216ENST00000617451 DPH3Q96FX2 82 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRF-216ENST00000617451 PGLYRP4Q96LB8 373 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRF-216ENST00000617451 MANBALQ9NQG1 85 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRF-216ENST00000617451 A0A087WYN8 130 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRF-216ENST00000617451 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRF-216ENST00000617451 BCL2L11O43521 198 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRF-216ENST00000617451 GNG13Q9P2W3 67 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRF-216ENST00000617451 F2Z2F3 143 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRF-216ENST00000617451 CHTF8P0CG12 524 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRF-216ENST00000617451 SPACA4Q8TDM5 124 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRF-216ENST00000617451 NIT2Q9NQR4 276 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRF-216ENST00000617451 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
PTPRF-216ENST00000617451 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa15.79■□□□□ 0.12
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