RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa11.34□□□□□ -0.59
CTIF-205ENST00000587860 LINC01549A6NIU2 74 aa11.34□□□□□ -0.59
CTIF-205ENST00000587860 MGPP08493 103 aa11.34□□□□□ -0.59
CTIF-205ENST00000587860 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa11.34□□□□□ -0.59
CTIF-205ENST00000587860 ANKRD29Q8N6D5 301 aa11.34□□□□□ -0.59
CTIF-205ENST00000587860 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
CTIF-205ENST00000587860 HHLA3Q9XRX5 114 aa11.34□□□□□ -0.59
CTIF-205ENST00000587860 SMIM9A6NGZ8 99 aa11.34□□□□□ -0.59
CTIF-205ENST00000587860 TENM4Q6N022 2769 aa11.34□□□□□ -0.59
CTIF-205ENST00000587860 FAM223BA6NKX1 122 aa11.33□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 FAM223AQ8IWN6 122 aa11.33□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 GATD1Q8NB37 220 aa11.33□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 CHCHD5Q9BSY4 110 aa11.33□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 MUC4Q99102 2169 aa11.33□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 HTN1P15515 57 aa11.33□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 DEFB136Q30KP8 78 aa11.33□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 COX8CQ7Z4L0 72 aa11.33□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa11.33□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 OR10J6PQ8NGY7 276 aa11.33□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 B4DSR2 109 aa11.32□□□□□ -0.6
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CTIF-205ENST00000587860 PRM2P04554 102 aa11.32□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa11.32□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 A8MWV9 139 aa11.32□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 C18orf65Q6ZTR6 163 aa11.31□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa11.31□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 NDUFA4O00483 81 aa11.31□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 RASL10AQ92737 203 aa11.31□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 IGKCP01834 107 aa11.3□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 SYNJ2BPP57105 145 aa11.3□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 A0A087WWL8 130 aa11.3□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa11.3□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 RBAKDNA6NC62 111 aa11.29□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 PSMG4Q5JS54 123 aa11.29□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 C9orf139Q6ZV77 190 aa11.29□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 TMEM190Q8WZ59 177 aa11.29□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 C11orf44Q8N8P7 122 aa11.29□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 TMEM89A2RUT3 159 aa11.29□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 SOCS3O14543 225 aa11.29□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 AKAP9Q99996 3911 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 TCL1BO95988 128 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 NRACQ8N912 160 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 C15orf53Q8NAA6 179 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 CNFNQ9BYD5 112 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 HLA-DRB4P13762 266 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 FAM74A4Q5TZK3 123 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 LINC00477Q96M19 166 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 KLK9Q9UKQ9 250 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa11.28□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 SCGB1C2P0DMR2 95 aa11.27□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 EMP1P54849 157 aa11.27□□□□□ -0.6
CTIF-205ENST00000587860 IGLV1-40P01703 118 aa11.26□□□□□ -0.61
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CTIF-205ENST00000587860 TMEM126AQ9H061 195 aa11.26□□□□□ -0.61
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CTIF-205ENST00000587860 LINC01587Q99440 93 aa11.25□□□□□ -0.61
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CTIF-205ENST00000587860 CD7P09564 240 aa11.25□□□□□ -0.61
CTIF-205ENST00000587860 SPINK13Q1W4C9 94 aa11.25□□□□□ -0.61
CTIF-205ENST00000587860 KLK9Q2XQG4 91 aa11.25□□□□□ -0.61
CTIF-205ENST00000587860 DNAJC30Q96LL9 226 aa11.25□□□□□ -0.61
CTIF-205ENST00000587860 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa11.25□□□□□ -0.61
CTIF-205ENST00000587860 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa11.25□□□□□ -0.61
CTIF-205ENST00000587860 TRAV21A0A0B4J279 112 aa11.25□□□□□ -0.61
CTIF-205ENST00000587860 F5H697 171 aa11.25□□□□□ -0.61
CTIF-205ENST00000587860 DPM2O94777 84 aa11.25□□□□□ -0.61
CTIF-205ENST00000587860 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CTIF-205ENST00000587860 ASIPP42127 132 aa11.25□□□□□ -0.61
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CTIF-205ENST00000587860 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
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CTIF-205ENST00000587860 C9JAW5 83 aa11.23□□□□□ -0.61
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CTIF-205ENST00000587860 Q8N8P6 123 aa11.23□□□□□ -0.61
CTIF-205ENST00000587860 LINC01356Q8N9X3 169 aa11.23□□□□□ -0.61
CTIF-205ENST00000587860 MDFICQ9P1T7 246 aa11.23□□□□□ -0.61
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CTIF-205ENST00000587860 LAGE3Q14657 143 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-205ENST00000587860 TAL2Q16559 108 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-205ENST00000587860 OVOL1O14753 267 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-205ENST00000587860 DCANP1Q8TF63 244 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-205ENST00000587860 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
CTIF-205ENST00000587860 FASNP49327 2511 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CTIF-205ENST00000587860 SLURP1P55000 103 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-205ENST00000587860 CFHR3Q02985 330 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-205ENST00000587860 MRAPQ8TCY5 172 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-205ENST00000587860 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa11.21□□□□□ -0.61
CTIF-205ENST00000587860 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa11.21□□□□□ -0.61
CTIF-205ENST00000587860 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
CTIF-205ENST00000587860 SLC25A20O43772 301 aa11.21□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 MYOZ3Q8TDC0 251 aa11.21□□□□□ -0.62
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