RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512069.6

PDE4D-220, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4D, Length 536 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-220ENST00000512069 PDCD6O75340 191 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-220ENST00000512069 P2RX1P51575 399 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-220ENST00000512069 MTPNP58546 118 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-220ENST00000512069 DEFB112Q30KQ8 113 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-220ENST00000512069 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
PDE4D-220ENST00000512069 LAIR2Q6ISS4 152 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-220ENST00000512069 LCN8Q6JVE9 175 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
PDE4D-220ENST00000512069 AAED1Q7RTV5 226 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-220ENST00000512069 NPBQ8NG41 125 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-220ENST00000512069 OR2T10Q8NGZ9 312 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-220ENST00000512069 OR52P1PQ8NH57 321 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-220ENST00000512069 OR9G1Q8NH87 305 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-220ENST00000512069 RPS4Y2Q8TD47 263 aa2.56□□□□□ -2
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PDE4D-220ENST00000512069 TVP23CQ96ET8 276 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-220ENST00000512069 FAM19A4Q96LR4 140 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-220ENST00000512069 PRELID3AQ96N28 172 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-220ENST00000512069 C18orf15Q96N68 181 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-220ENST00000512069 SPACA5Q96QH8 159 aa2.56□□□□□ -2
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PDE4D-220ENST00000512069 STARD9Q9P2P6 4700 aa2.56□□□□□ -2
PDE4D-220ENST00000512069 SMIM26A0A096LP01 95 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-220ENST00000512069 GRIFINA4D1Z8 144 aa2.55□□□□□ -2
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PDE4D-220ENST00000512069 H3BMG7 143 aa2.55□□□□□ -2
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PDE4D-220ENST00000512069 H3BUT2 72 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-220ENST00000512069 M0R129 80 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF737O75373 536 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF823P16415 610 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-220ENST00000512069 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP2.55□□□□□ -2
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PDE4D-220ENST00000512069 WFDC2Q14508 124 aa2.55□□□□□ -2
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PDE4D-220ENST00000512069 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-220ENST00000512069 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-220ENST00000512069 MSRB3Q8IXL7 192 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-220ENST00000512069 SLC22A24Q8N4F4 322 aa2.55□□□□□ -2
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PDE4D-220ENST00000512069 METTL26Q96S19 204 aa2.55□□□□□ -2
PDE4D-220ENST00000512069 PRSS27Q9BQR3 290 aa2.55□□□□□ -2
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PDE4D-220ENST00000512069 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa2.54□□□□□ -2
PDE4D-220ENST00000512069 FAM24AA6NFZ4 105 aa2.54□□□□□ -2
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PDE4D-220ENST00000512069 MPV17LQ2QL34 196 aa2.54□□□□□ -2
PDE4D-220ENST00000512069 ETDBQ3ZM63 59 aa2.54□□□□□ -2
PDE4D-220ENST00000512069 NMSQ5H8A3 153 aa2.54□□□□□ -2
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PDE4D-220ENST00000512069 BRD3OSQ6XYD6 125 aa2.54□□□□□ -2
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