RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488279.6

PTPN4-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 5

Gene PTPN4, Length 662 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-211ENST00000488279 RAB5CP51148 216 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPN4-211ENST00000488279 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPN4-211ENST00000488279 C11orf52Q96A22 123 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPN4-211ENST00000488279 DERL1Q9BUN8 251 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPN4-211ENST00000488279 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPN4-211ENST00000488279 PKIAP61925 76 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPN4-211ENST00000488279 C15orf54Q8N8G6 183 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPN4-211ENST00000488279 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPN4-211ENST00000488279 CHCHD5Q9BSY4 110 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPN4-211ENST00000488279 C1orf43Q9BWL3 253 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPN4-211ENST00000488279 CRPP02741 224 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPN4-211ENST00000488279 LINC01620Q4KN68 170 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPN4-211ENST00000488279 TMEM97Q5BJF2 176 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPN4-211ENST00000488279 ENHOQ6UWT2 76 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPN4-211ENST00000488279 AP1S3Q96PC3 154 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPN4-211ENST00000488279 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPN4-211ENST00000488279 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PTPN4-211ENST00000488279 MPV17L2Q567V2 206 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPN4-211ENST00000488279 CENPWQ5EE01 88 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPN4-211ENST00000488279 ANGP03950 147 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PTPN4-211ENST00000488279 RPS20P60866 119 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PTPN4-211ENST00000488279 TPPP3Q9BW30 176 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPN4-211ENST00000488279 VAX2Q9UIW0 290 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPN4-211ENST00000488279 GZMBP10144 247 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPN4-211ENST00000488279 C14orf177Q52M58 125 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPN4-211ENST00000488279 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PTPN4-211ENST00000488279 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPN4-211ENST00000488279 OR2D3Q8NGH3 330 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPN4-211ENST00000488279 IGLV2-8P01709 118 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPN4-211ENST00000488279 GNG4P50150 75 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPN4-211ENST00000488279 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPN4-211ENST00000488279 LINC00528Q8N1L1 170 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPN4-211ENST00000488279 SMIM12Q96EX1 92 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPN4-211ENST00000488279 RAB19A4D1S5 217 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPN4-211ENST00000488279 PDE6DO43924 150 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPN4-211ENST00000488279 IGLC6P0CF74 106 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPN4-211ENST00000488279 SULT1A2P50226 295 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPN4-211ENST00000488279 XKRY2A2RUG3 117 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPN4-211ENST00000488279 C19orf71A6NCJ1 209 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPN4-211ENST00000488279 CACNG7P62955 275 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPN4-211ENST00000488279 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPN4-211ENST00000488279 MIAQ16674 131 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPN4-211ENST00000488279 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPN4-211ENST00000488279 H7C1H1 209 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPN4-211ENST00000488279 M0QY20 66 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPN4-211ENST00000488279 IFNA1P01562 189 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPN4-211ENST00000488279 MGPP08493 103 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPN4-211ENST00000488279 SCXQ7RTU7 201 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPN4-211ENST00000488279 CHAC1Q9BUX1 264 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPN4-211ENST00000488279 MED9Q9NWA0 146 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPN4-211ENST00000488279 F2Z2F3 143 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPN4-211ENST00000488279 P01737 135 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPN4-211ENST00000488279 GAGE6Q13070 117 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPN4-211ENST00000488279 BIN3Q9NQY0 253 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPN4-211ENST00000488279 RBX1P62877 108 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPN4-211ENST00000488279 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPN4-211ENST00000488279 HLA-DQA1P01909 254 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPN4-211ENST00000488279 IQCJQ1A5X6 159 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPN4-211ENST00000488279 SUMO4Q6EEV6 95 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPN4-211ENST00000488279 LINC00269Q8N2A0 174 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPN4-211ENST00000488279 PRR34Q9NV39 138 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPN4-211ENST00000488279 USP17L23D6RBM5 183 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPN4-211ENST00000488279 BCL2P10415 239 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPN4-211ENST00000488279 TCTE3Q8IZS6 198 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPN4-211ENST00000488279 J3QL48 77 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPN4-211ENST00000488279 TRGC1P0CF51 173 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPN4-211ENST00000488279 LYZL1Q6UWQ5 148 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPN4-211ENST00000488279 SLC51BQ86UW2 128 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPN4-211ENST00000488279 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPN4-211ENST00000488279 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPN4-211ENST00000488279 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPN4-211ENST00000488279 NTF3P20783 257 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPN4-211ENST00000488279 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPN4-211ENST00000488279 CLPSL2Q6UWE3 100 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPN4-211ENST00000488279 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPN4-211ENST00000488279 RASL11AQ6T310 242 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPN4-211ENST00000488279 C9orf62Q8N4C0 152 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPN4-211ENST00000488279 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPN4-211ENST00000488279 WDR73Q6P4I2 378 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPN4-211ENST00000488279 NUDT10Q8NFP7 164 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPN4-211ENST00000488279 NUDT11Q96G61 164 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPN4-211ENST00000488279 DPH3P1Q9H4G8 78 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPN4-211ENST00000488279 PRSS1P07477 247 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPN4-211ENST00000488279 NIT2Q9NQR4 276 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPN4-211ENST00000488279 REG3AQ06141 175 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPN4-211ENST00000488279 TMEM243Q9BU79 118 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPN4-211ENST00000488279 TWIST1Q15672 202 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPN4-211ENST00000488279 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPN4-211ENST00000488279 A0A1B0GUV1 79 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPN4-211ENST00000488279 CTRLP40313 264 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPN4-211ENST00000488279 PGLYRP4Q96LB8 373 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPN4-211ENST00000488279 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPN4-211ENST00000488279 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPN4-211ENST00000488279 C20orf203Q8NBC4 194 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPN4-211ENST00000488279 CLRN3Q8NCR9 226 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPN4-211ENST00000488279 OCC1Q8TAD7 63 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPN4-211ENST00000488279 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPN4-211ENST00000488279 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPN4-211ENST00000488279 C9orf163Q8N9P6 203 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPN4-211ENST00000488279 CNFNQ9BYD5 112 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.9 ms