RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482419.1

FAM208B-208, Transcript of family with sequence similarity 208 member B, human

TSL 2

Gene FAM208B, Length 424 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM208B-208	ENST00000482419	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		0.3	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	SEC11C	Q9BY50	192 aa		0.3	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		0.3	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	MYH8	P13535	1937 aa		0.29	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		0.29	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	COX6A2	Q02221	97 aa		0.29	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	CACNA1H	O95180	2353 aa		0.29	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	TTC28	Q96AY4	2481 aa		0.29	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	MYO7A	Q13402	2215 aa		0.29	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	DAPK1	P53355	1430 aa		0.29	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	MYH7	P12883	1935 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	FAM92A	A1XBS5	289 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	GNG7	O60262	68 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	GCHFR	P30047	84 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		0.28	□□□□□ -2.36
FAM208B-208	ENST00000482419	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	0.27	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		0.27	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		0.27	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	FAM25A	B3EWG3	89 aa		0.27	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	FAM25C	B3EWG5	89 aa		0.27	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	FAM25G	B3EWG6	89 aa		0.27	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		0.27	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	NDUFA2	O43678	99 aa		0.27	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	S100A12	P80511	92 aa		0.27	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	TSC22D3	Q99576	134 aa		0.27	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		0.27	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		0.27	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		0.27	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		0.26	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	INSL4	Q14641	139 aa		0.26	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		0.26	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	ARL11	Q969Q4	196 aa		0.26	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		0.26	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		0.26	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	GRIN2A	Q12879	1464 aa		0.26	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	PHLPP1	O60346	1717 aa		0.26	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	CAD	P27708	2225 aa		0.26	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		0.26	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	POLQ	O75417	2590 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	UNC13B	O14795	1591 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	IGF2R	P11717	2491 aa		0.25	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	GOLGA3	Q08378	1498 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	HMGN1	P05114	100 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	SMIM6	P0DI80	62 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	SELENOW	P63302	87 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	CCL8	P80075	99 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	IFT172	Q9UG01	1749 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		0.24	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	PIEZO1	Q92508	2521 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	HCG22	E2RYF7	251 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	SPINK1	P00995	79 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419		Q5BKY6	102 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		0.23	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	ANK2	Q01484	3957 aa		0.22	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	DOCK1	Q14185	1865 aa		0.22	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		0.22	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419		G3V318	75 aa		0.22	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		0.22	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		0.22	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		0.22	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	COPS9	Q8WXC6	57 aa		0.22	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	PATJ	Q8NI35	1801 aa		0.22	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	IFT140	Q96RY7	1462 aa		0.22	□□□□□ -2.37
FAM208B-208	ENST00000482419	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		0.21	□□□□□ -2.38
FAM208B-208	ENST00000482419	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		0.21	□□□□□ -2.38
FAM208B-208	ENST00000482419	ZNF815P	A8K554	130 aa		0.21	□□□□□ -2.38
FAM208B-208	ENST00000482419	SIX6	O95475	246 aa		0.21	□□□□□ -2.38
FAM208B-208	ENST00000482419	PPP1R17	O96001	155 aa		0.21	□□□□□ -2.38
FAM208B-208	ENST00000482419	C10orf128	Q5T292	105 aa		0.21	□□□□□ -2.38
FAM208B-208	ENST00000482419	BAGE3	Q86Y29	109 aa		0.21	□□□□□ -2.38
FAM208B-208	ENST00000482419	RERGL	Q9H628	205 aa		0.21	□□□□□ -2.38
FAM208B-208	ENST00000482419	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		0.21	□□□□□ -2.38
FAM208B-208	ENST00000482419	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	0.21	□□□□□ -2.38
FAM208B-208	ENST00000482419	PRDM2	Q13029	1718 aa		0.21	□□□□□ -2.38
FAM208B-208	ENST00000482419	LRRC37A3	O60309	1634 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM208B-208	ENST00000482419	DOCK2	Q92608	1830 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM208B-208	ENST00000482419		Q8N8P6	123 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM208B-208	ENST00000482419	AQP10	Q96PS8	301 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM208B-208	ENST00000482419	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM208B-208	ENST00000482419	CFTR	P13569	1480 aa		0.2	□□□□□ -2.38
FAM208B-208	ENST00000482419	F8	P00451	2351 aa		0.19	□□□□□ -2.38
FAM208B-208	ENST00000482419	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		0.19	□□□□□ -2.38
FAM208B-208	ENST00000482419	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		0.19	□□□□□ -2.38
FAM208B-208	ENST00000482419	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
FAM208B-208	ENST00000482419	CACNA1C	Q13936	2221 aa		0.18	□□□□□ -2.38

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