RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 MED28Q9H204 178 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-210ENST00000481231 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 GIPP09681 153 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 FHITP49789 147 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 PKIAP61925 76 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 RBX1P62877 108 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 GAGE6Q13070 117 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 CST9LP1Q5W188 147 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 TCEAL7Q9BRU2 100 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 PRR34Q9NV39 138 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 AKR1C3P42330 323 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 VAX2Q9UIW0 290 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 F5H697 171 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 SNAI2O43623 268 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 CXCL1P09341 107 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM97Q5BJF2 176 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 STOML3Q8TAV4 291 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 DERL1Q9BUN8 251 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 OR5AL1P0C617 328 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 SSTP61278 116 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 SPANXN1Q5VSR9 72 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 MLST8Q9BVC4 326 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 DPH3P1Q9H4G8 78 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 CYTL1Q9NRR1 136 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.99□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A0D9SG52 128 aa5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 SCO2A0A1W2PP80 73 aa5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 hDV102S1A0JD36 115 aa5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 G3V3Q6 166 aa5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 PAGE4O60829 102 aa5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 REG3AQ06141 175 aa5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 IQCJQ1A5X6 159 aa5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 BAGE2Q86Y30 109 aa5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 CLRN3Q8NCR9 226 aa5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 AP1S3Q96PC3 154 aa5.98□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A1B0GV50 99 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 SLPIP03973 132 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 S100A9P06702 114 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 CHTF8P0CG12 524 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 SMIM17P0DL12 118 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 C20orf203Q8NBC4 194 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 GFRA4Q9GZZ7 299 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A087WYN8 130 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 M0QY20 66 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 ARPC5O15511 151 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 SPACA4Q8TDM5 124 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 SFT2D1Q8WV19 159 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 RNF185Q96GF1 192 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC01600Q96MT4 127 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 PFDN1O60925 122 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 P01737 135 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 MGPP08493 103 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 GZMBP10144 247 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 RAB5CP51148 216 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 SUMO4Q6EEV6 95 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM213BQ8TBF2 198 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 MBD3L1Q8WWY6 194 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 DPH3Q96FX2 82 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM243Q9BU79 118 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 TPPP3Q9BW30 176 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 AP5S1Q9NUS5 200 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A1B0GUV1 79 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 H7C1H1 209 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 RPL35P42766 123 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A0U1RQV1 116 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 PHOX2AO14813 284 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 IGLC6P0CF74 106 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 TMUB2Q71RG4 321 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 C15orf56Q8N910 161 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A0J9YXV3 536 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 UMAD1C9J7I0 102 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 SMLR1H3BR10 107 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 RASL11AQ6T310 242 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-210ENST00000481231 KCNRGQ8N5I3 272 aa5.92□□□□□ -1.46
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