RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 FOXI1Q12951 378 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-207ENST00000479054 Q9HAA7 133 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-207ENST00000479054 SMIM9A6NGZ8 99 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-207ENST00000479054 FXYD2P54710 66 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-207ENST00000479054 CARD19Q96LW7 228 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-207ENST00000479054 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-207ENST00000479054 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-207ENST00000479054 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
NISCH-207ENST00000479054 HTTP42858 3142 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-207ENST00000479054 EXPH5Q8NEV8 1989 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-207ENST00000479054 EML5Q05BV3 1969 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-207ENST00000479054 CRYGBP07316 175 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-207ENST00000479054 PFN2P35080 140 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-207ENST00000479054 HILS1P60008 231 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-207ENST00000479054 TMEM61Q8N0U2 210 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-207ENST00000479054 GTSF1Q8WW33 167 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-207ENST00000479054 LY6LH3BQJ8 138 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-207ENST00000479054 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-207ENST00000479054 PRAC2D3DTV9 90 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-207ENST00000479054 TEN1Q86WV5 123 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-207ENST00000479054 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-207ENST00000479054 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
NISCH-207ENST00000479054 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa10.41□□□□□ -0.74
NISCH-207ENST00000479054 HERV-K104P63124 156 aa10.4□□□□□ -0.74
NISCH-207ENST00000479054 RNF183Q96D59 192 aa10.4□□□□□ -0.74
NISCH-207ENST00000479054 NDUFA12Q9UI09 145 aa10.4□□□□□ -0.74
NISCH-207ENST00000479054 Q6ZQT7 251 aa10.4□□□□□ -0.74
NISCH-207ENST00000479054 C11orf45Q8TAV5 145 aa10.4□□□□□ -0.74
NISCH-207ENST00000479054 HHLA3Q9XRX5 114 aa10.4□□□□□ -0.74
NISCH-207ENST00000479054 EBI3Q14213 229 aa10.4□□□□□ -0.74
NISCH-207ENST00000479054 C14orf177Q52M58 125 aa10.4□□□□□ -0.74
NISCH-207ENST00000479054 CHD7Q9P2D1 2997 aa10.4□□□□□ -0.74
NISCH-207ENST00000479054 HCFC1P51610 2035 aa10.4□□□□□ -0.74
NISCH-207ENST00000479054 Q6ZSV7 163 aa10.4□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 SPATA12Q7Z6I5 190 aa10.39□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 LINC01548A6NM66 108 aa10.39□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 J3KT08 172 aa10.39□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 MAP6D1Q9H9H5 199 aa10.39□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 HIGD1BQ9P298 99 aa10.39□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 MSRB1Q9NZV6 116 aa10.39□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa10.38□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 CFC1BP0CG36 223 aa10.38□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 CFC1P0CG37 223 aa10.38□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 XCL1P47992 114 aa10.38□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 SOCS3O14543 225 aa10.38□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 PRO0255Q9UI72 69 aa10.38□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 NAV3Q8IVL0 2385 aa10.38□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 A0A0J9YX75 114 aa10.38□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 ODF3Q96PU9 254 aa10.38□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa10.38□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 CAMK2N2Q96S95 79 aa10.38□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 SLC25A29Q8N8R3 303 aa10.37□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 C19orf71A6NCJ1 209 aa10.37□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 CDSNQ15517 529 aa10.37□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 CCDC140Q96MF4 163 aa10.37□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 SPTBN4Q9H254 2564 aa10.37□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 LYRM9A8MSI8 78 aa10.37□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 NXPH4O95158 308 aa10.37□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 CLPSL2Q6UWE3 100 aa10.37□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa10.37□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 COX7A2LO14548 114 aa10.37□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 IGLV2-8P01709 118 aa10.37□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 TRBV12-3P01733 135 aa10.36□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa10.36□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 J3QQQ9 107 aa10.36□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa10.36□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa10.35□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 IGHV3-30P01768 117 aa10.35□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 IGHV3-33P01772 117 aa10.35□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa10.35□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa10.35□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 CTRLP40313 264 aa10.35□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 WNK1Q9H4A3 2382 aa10.35□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 RPL32P62910 135 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 TRAV4A0A0B4J268 109 aa10.35□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa10.35□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 TIRAPP58753 221 aa10.35□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 SUMO4Q6EEV6 95 aa10.35□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 Q8N1Y9 231 aa10.35□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 TTTY13Q9BZ97 58 aa10.35□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 SONP18583 2426 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 ACYP1P07311 99 aa10.34□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 DEFB114Q30KQ6 69 aa10.34□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 CHD8Q9HCK8 2581 aa10.34□□□□□ -0.75
NISCH-207ENST00000479054 MYO9AB2RTY4 2548 aa10.33□□□□□ -0.76
NISCH-207ENST00000479054 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa10.33□□□□□ -0.76
NISCH-207ENST00000479054 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa10.33□□□□□ -0.76
NISCH-207ENST00000479054 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa10.33□□□□□ -0.76
NISCH-207ENST00000479054 NDUFA7O95182 113 aa10.33□□□□□ -0.76
NISCH-207ENST00000479054 Q6ZUT4 128 aa10.33□□□□□ -0.76
NISCH-207ENST00000479054 CXCL5P42830 114 aa10.33□□□□□ -0.76
NISCH-207ENST00000479054 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
NISCH-207ENST00000479054 MLST8Q9BVC4 326 aa10.33□□□□□ -0.76
NISCH-207ENST00000479054 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
NISCH-207ENST00000479054 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
NISCH-207ENST00000479054 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
NISCH-207ENST00000479054 MT-ATP8P03928 68 aa10.32□□□□□ -0.76
NISCH-207ENST00000479054 MIFP14174 115 aa10.32□□□□□ -0.76
NISCH-207ENST00000479054 CLUHP3Q96NS8 147 aa10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms