RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-205ENST00000444916 CTRLP40313 264 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-205ENST00000444916 LYZL1Q6UWQ5 148 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-205ENST00000444916 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-205ENST00000444916 PSCAO43653 123 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-205ENST00000444916 CDPF1Q6NVV7 123 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-205ENST00000444916 NIT1Q86X76 327 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM210AQ96ND0 272 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-205ENST00000444916 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-205ENST00000444916 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-205ENST00000444916 MGPP08493 103 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 TRGC1P0CF51 173 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 CEBPGP53567 150 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 WDR73Q6P4I2 378 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 CHCHD7Q9BUK0 85 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 CNFNQ9BYD5 112 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 LRCOL1A6NCL2 159 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 H7C1H1 209 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 NTF3P20783 257 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 SUMO4Q6EEV6 95 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM231DQ6ZW35 169 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 A0A087WX48 190 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 M0QY20 66 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 SMIM7Q9BQ49 75 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 TM2D2Q9BX73 214 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 DPH3P1Q9H4G8 78 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 GATCO43716 136 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 SRP19P09132 144 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.94e-7■■■■□ 23.7
SH3BP4-205ENST00000444916 TWIST1Q15672 202 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM97Q5BJF2 176 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 KCNIP4Q6PIL6 250 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 TEX261Q6UWH6 196 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 GTSF1Q8WW33 167 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 DNAJC30Q96LL9 226 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF727A8MUV8 499 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 ELOBQ15370 118 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 CT83Q5H943 113 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 LINC01551Q86U37 167 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 KLK12Q9UKR0 248 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 A8MWL6 223 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 RASL11AQ6T310 242 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM262E9PQX1 116 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 PKIAP61925 76 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 Q8N814 137 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 RMI2Q96E14 147 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 CHCHD5Q9BSY4 110 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 COX11Q9Y6N1 276 aa9.4□□□□□ -0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 MPV17L2Q567V2 206 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 UBE2WQ96B02 151 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 NIT2Q9NQR4 276 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 FAT1Q14517 4588 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 IQCJQ1A5X6 159 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM74A3Q4VXF1 159 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 ATRAIDQ6UW56 229 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 SMIM15Q7Z3B0 74 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 FRZBQ92765 325 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 PGLYRP4Q96LB8 373 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 OSTCQ9NRP0 149 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 MYCBP2O75592 4640 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 Q0VG73 95 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 WFDC2Q14508 124 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 PEA15Q15121 130 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 C15orf54Q8N8G6 183 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 GATD1Q8NB37 220 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 TSKUQ8WUA8 353 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 GFRA4Q9GZZ7 299 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM231BA6NCW3 169 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 HIGD1CA8MV81 97 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 C9JQL5 133 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 CRPP02741 224 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 ANGP03950 147 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 GCSHP23434 173 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 KRTAP10-1P60331 282 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM241Q24JQ0 296 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 Q8N976 141 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 BORCS7Q96B45 105 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 SMDT1Q9H4I9 107 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 EPM2AB3EWF7 344 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 LECT2O14960 151 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 GAGE6Q13070 117 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 ENHOQ6UWT2 76 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 ISOC2Q96AB3 205 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 V9GYV3 84 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
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