RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
NISCH-202ENST00000420808 ZNF815PA8K554 130 aa11.47□□□□□ -0.57
NISCH-202ENST00000420808 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
NISCH-202ENST00000420808 DEFB131AP59861 70 aa11.47□□□□□ -0.57
NISCH-202ENST00000420808 VCYO14598 125 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-202ENST00000420808 KIR2DL4Q99706 377 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-202ENST00000420808 NACAE9PAV3 2078 aa11.46□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa11.46□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 SFTA2Q6UW10 78 aa11.46□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 UBE2E2Q96LR5 201 aa11.46□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 ACANP16112 2415 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 J3QLI3 93 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 PPP1R17O96001 155 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 RIPPLY3P57055 190 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 JMJD1CQ15652 2540 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 ELANEP08246 267 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 Q5PR19 223 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 PMVKQ15126 192 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 ODF3Q96PU9 254 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 TMEM89A2RUT3 159 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 TMEM170BQ5T4T1 132 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 TMEM61Q8N0U2 210 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 C11orf44Q8N8P7 122 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 ZNF479Q96JC4 524 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 H3BMG7 143 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 SCGB1D4Q6XE38 83 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 FOXI2Q6ZQN5 318 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 ZNF843Q8N446 348 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 Q96MF0 132 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 RPL32P62910 135 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 SCGB2A2Q13296 93 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 SAMD13Q5VXD3 122 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 MTORP42345 2549 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 TAL2Q16559 108 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 Q6ZSN1 163 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 SYT8Q8NBV8 401 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 OR5A1Q8NGJ0 315 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 WFDC2Q14508 124 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 K7ERU9 68 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 TIMM17AQ99595 171 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 H3BMM0 161 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 RPL24P83731 157 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 RNF152Q8N8N0 203 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
NISCH-202ENST00000420808 RRN3P1Q2M238 152 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 DEFB113Q30KQ7 82 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 A0A0J9YY99 117 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 G3V4G9 280 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP11.39□□□□□ -0.597e-6■■■■□ 19.5
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NISCH-202ENST00000420808 AMELXQ99217 191 aa11.39□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 SH2D6Q7Z4S9 175 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 TMEM141Q96I45 108 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 A0A1B0GWB2 263 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 C20orf203Q8NBC4 194 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 C2CD3Q4AC94 2353 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 A0A0J9YXV3 536 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 LINC01549A6NIU2 74 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 LINC01619G3V211 115 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 APOMO95445 188 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 ITPR2Q14571 2701 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 A0A1W2PRX2 142 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 MAP6D1Q9H9H5 199 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 TRGV11A0A075B6L2 103 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 I3L3M4 83 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 CD28P10747 220 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 WFDC11Q8NEX6 87 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 J3QQQ9 107 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 TSPAN13O95857 204 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 UBE2D1P51668 147 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 ETDBQ3ZM63 59 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 Q8N2B8 174 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-202ENST00000420808 AZU1P20160 251 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 HERVK_113P61574 105 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 PDZD2O15018 2839 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 INSL3P51460 131 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 RHOHQ15669 191 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 Q6ZSV7 163 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 PRO0461Q9UI25 63 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 TMEM223A0PJW6 202 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-202ENST00000420808 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
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