RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 AMTNQ6UX39 209 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 OR10D4PQ8NGN7 298 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 AP1S3Q96PC3 154 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 SAMD10Q9BYL1 202 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 SCRT2Q9NQ03 307 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 HSBP1O75506 76 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 IGLV1-51P01701 117 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 PMCHP20382 165 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 S100A4P26447 101 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 AMTP48728 403 aa4.76□□□□□ -1.65
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CCL20-202ENST00000409189 IQCJQ1A5X6 159 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 SPANXN1Q5VSR9 72 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 TMEM256Q8N2U0 113 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 OR10AG1Q8NH19 301 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 LINC00467Q9BRT7 94 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
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CCL20-202ENST00000409189 OR11H12B2RN74 326 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 D6R8Y8 96 aa4.75□□□□□ -1.65
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CCL20-202ENST00000409189 SAP30O75446 220 aa4.75□□□□□ -1.65
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CCL20-202ENST00000409189 S100A12P80511 92 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 SPINK13Q1W4C9 94 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 PYY3Q5JQD4 70 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 AMN1Q8IY45 258 aa4.75□□□□□ -1.65
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CCL20-202ENST00000409189 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 M0R2Z0 102 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 M0R381 172 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 INSL3P51460 131 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 MUC21Q5SSG8 566 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 SBSPONQ8IVN8 264 aa4.74□□□□□ -1.65
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CCL20-202ENST00000409189 RNF185Q96GF1 192 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 C9orf85Q96MD7 179 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 PRELID3AQ96N28 172 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 NDUFAF3Q9BU61 184 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 MAP1LC3AQ9H492 121 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 DPH3P1Q9H4G8 78 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 EDA2RQ9HAV5 297 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 SELENOKQ9Y6D0 94 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 KNCNA6PVL3 124 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 CRXO43186 299 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
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CCL20-202ENST00000409189 CKS2P33552 79 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 ZNF415Q09FC8 603 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 FA2HQ7L5A8 372 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 STHQ8IWL8 128 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 POM121L12Q8N7R1 296 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 HSPG2P98160 4391 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 MUC21A0A140T8X8 626 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 C20orf202A1L168 122 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 LINC01546A6NGU7 62 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 K7EMI3 77 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 NCR2O95944 276 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 NPYP01303 97 aa4.72□□□□□ -1.65
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CCL20-202ENST00000409189 LINC00614P0C842 121 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 SMIM17P0DL12 118 aa4.72□□□□□ -1.65
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CCL20-202ENST00000409189 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 NIT2Q9NQR4 276 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 HSPB8Q9UJY1 196 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 DNAH11Q96DT5 4516 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 CBY3A6NI87 242 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 HBDP02042 147 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 RBMY1CP0DJD4 496 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 EVI2AP22794 236 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 RPL32P62910 135 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 C9orf66Q5T8R8 295 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 TEX43Q6ZNM6 134 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 C20orf78Q9BR46 151 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa4.71□□□□□ -1.66
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