RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368358.3

HCN3-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN3, Length 3,718 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3-201ENST00000368358 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 C12orf54Q6X4T0 127 aa9.82□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 SCRT2Q9NQ03 307 aa9.82□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 K7EMI3 77 aa9.81□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 TMEM170BQ5T4T1 132 aa9.81□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa9.81□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.81□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 RRN3P1Q2M238 152 aa9.81□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 TRGV2A0A075B6R0 118 aa9.81□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 VCYO14598 125 aa9.81□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 COX8AP10176 69 aa9.81□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 ODF1Q14990 250 aa9.81□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 PPP1R17O96001 155 aa9.8□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 SPATA3Q8NHX4 192 aa9.8□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.8□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 DEFB4AO15263 64 aa9.8□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 RBMY1CP0DJD4 496 aa9.8□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 DEFB130BP0DP73 79 aa9.79□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 DEFB130AP0DP74 79 aa9.79□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa9.79□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 FHL3Q13643 280 aa9.79□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.79□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 C20orf78Q9BR46 151 aa9.79□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa9.79□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 ZNF415Q09FC8 603 aa9.78□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 OXLD1Q5BKU9 147 aa9.78□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa9.78□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 NPSP0C0P6 89 aa9.78□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 OR11H2Q8NH07 326 aa9.78□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
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HCN3-201ENST00000368358 PRSS29PA6NIE9 313 aa9.77□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 GAGE7O76087 117 aa9.77□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 GAGE12FP0CL80 117 aa9.77□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 GAGE12GP0CL81 117 aa9.77□□□□□ -0.85
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HCN3-201ENST00000368358 AZU1P20160 251 aa9.77□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa9.77□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 H7C1H1 209 aa9.77□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 HTN3P15516 51 aa9.77□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 TRAV25A0A0B4J276 109 aa9.77□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa9.77□□□□□ -0.85
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HCN3-201ENST00000368358 ZFP2Q6ZN57 461 aa9.77□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa9.76□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 IGLV1-51P01701 117 aa9.76□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa9.76□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 A0A087WX48 190 aa9.76□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 LURAP1LQ8IV03 231 aa9.76□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 HIST1H4GQ99525 98 aa9.76□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 MED14OSP0DP75 135 aa9.75□□□□□ -0.85
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HCN3-201ENST00000368358 C9orf66Q5T8R8 295 aa9.75□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 K7EP13 123 aa9.75□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 CRYGDP07320 174 aa9.75□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa9.75□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 OR4C5Q8NGB2 326 aa9.75□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.74□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 Q9UF83 564 aa9.74□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 AKAP9Q99996 3911 aa9.74□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 F8VRH5 84 aa9.74□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 M0R2P5 195 aa9.74□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 BAALCQ8WXS3 180 aa9.74□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 DLEU1O43261 78 aa9.73□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 C9orf85Q96MD7 179 aa9.73□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa9.73□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 VCX2Q9H322 139 aa9.73□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 M0QY20 66 aa9.73□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 PLNP26678 52 aa9.73□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 TOMM6Q96B49 74 aa9.73□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 ODF3Q96PU9 254 aa9.73□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 SFTA2Q6UW10 78 aa9.72□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 A6NDN8 102 aa9.72□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 H3BUT2 72 aa9.72□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 LINC00315P59091 139 aa9.72□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa9.72□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 Q6ZTI0 123 aa9.72□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 ORAOV1Q8WV07 137 aa9.72□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.72□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa9.72□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 ZNF815PA8K554 130 aa9.71□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 I3L3M4 83 aa9.71□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 ZNRF2Q8NHG8 242 aa9.71□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 CHAC1Q9BUX1 264 aa9.71□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 COX11Q9Y6N1 276 aa9.71□□□□□ -0.85
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