RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621217.4

GGA3-222, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 4,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-222ENST00000621217 C10orf105Q8TEF2 133 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 F8P00451 2351 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 CTRLP40313 264 aa7.06□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 DEFB136Q30KP8 78 aa7.06□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.06□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.06□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 FXYD2P54710 66 aa7.06□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa7.06□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 LINC00574Q9H8X3 128 aa7.06□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.05□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 LTAP01374 205 aa7.05□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 RBMY1CP0DJD4 496 aa7.05□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 INAFM2P0DMQ5 153 aa7.05□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 KRTAP10-9P60411 292 aa7.05□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa7.05□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.05□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 Q8N8P6 123 aa7.05□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 F6UB75 175 aa7.05□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 F8VRH5 84 aa7.05□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 J3KT08 172 aa7.05□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 PRR25Q96S07 402 aa7.05□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.05□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 HIGD1BQ9P298 99 aa7.05□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 PRAC2D3DTV9 90 aa7.05□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 PAX1P15863 534 aa7.05□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7.05□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 Q8N9W7 124 aa7.05□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 ATRQ13535 2644 aa7.05□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 C2orf70A6NJV1 201 aa7.05□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 UBE2L6O14933 153 aa7.05□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.05□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 CTSGP08311 255 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 DSCR9P59020 149 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 FANCD2OSQ96PS1 177 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 C16orf54Q6UWD8 224 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 C11orf71Q6IPW1 123 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 C8orf31Q8N9H6 132 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 C20orf78Q9BR46 151 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 A0A0U1RRA0 63 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 VCYO14598 125 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 CRYGCP07315 174 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 CD28P10747 220 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 SIRPDQ9H106 197 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 CD7P09564 240 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 HLA-DRB4P13762 266 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-222ENST00000621217 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 NPC2P61916 151 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 PF4P02776 101 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 FOXE3Q13461 319 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 DEFB113Q30KQ7 82 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 Q6ZUT4 128 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 WFDC11Q8NEX6 87 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 VWC2LB2RUY7 222 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 INS-IGF2F8WCM5 200 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 TRBV12-3P01733 135 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 TMEM14CQ9P0S9 112 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 IGHG4P01861 327 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 LINC00310P59036 64 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
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GGA3-222ENST00000621217 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 CFC1BP0CG36 223 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 CFC1P0CG37 223 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 PDE6HQ13956 83 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 C10orf99Q6UWK7 81 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 OVOL2Q9BRP0 275 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 A0A087WWL8 130 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 LY6G5BQ8NDX9 201 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 CARD19Q96LW7 228 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 LINC00477Q96M19 166 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 MT-ATP8P03928 68 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 ACYP1P07311 99 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 CFHR4Q92496 578 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-222ENST00000621217 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
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