RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 ENY2Q9NPA8 101 aa2.79□□□□□ -1.96
PDE4D-217ENST00000509355 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
PDE4D-217ENST00000509355 C21orf62Q9NYP8 219 aa2.79□□□□□ -1.96
PDE4D-217ENST00000509355 TAS2R4Q9NYW5 299 aa2.79□□□□□ -1.96
PDE4D-217ENST00000509355 A0A0J9YY99 117 aa2.78□□□□□ -1.96
PDE4D-217ENST00000509355 K7ERU9 68 aa2.78□□□□□ -1.96
PDE4D-217ENST00000509355 GNGT2O14610 69 aa2.78□□□□□ -1.96
PDE4D-217ENST00000509355 FAM107AO95990 144 aa2.78□□□□□ -1.96
PDE4D-217ENST00000509355 CD2P06729 351 aa2.78□□□□□ -1.96
PDE4D-217ENST00000509355 METTL15P1P0C7V9 234 aa2.78□□□□□ -1.96
PDE4D-217ENST00000509355 SERPINB10P48595 397 aa2.78□□□□□ -1.96
PDE4D-217ENST00000509355 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
PDE4D-217ENST00000509355 KRTAP10-10P60014 251 aa2.78□□□□□ -1.96
PDE4D-217ENST00000509355 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
PDE4D-217ENST00000509355 RHOBP62745 196 aa2.78□□□□□ -1.96
PDE4D-217ENST00000509355 DHRS2Q13268 280 aa2.78□□□□□ -1.96
PDE4D-217ENST00000509355 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
PDE4D-217ENST00000509355 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM78Q5T7P6 136 aa2.78□□□□□ -1.96
PDE4D-217ENST00000509355 LPCAT3Q6P1A2 487 aa2.78□□□□□ -1.96
PDE4D-217ENST00000509355 SCXQ7RTU7 201 aa2.78□□□□□ -1.96
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM256Q8N2U0 113 aa2.78□□□□□ -1.96
PDE4D-217ENST00000509355 SLC25A29Q8N8R3 303 aa2.78□□□□□ -1.96
PDE4D-217ENST00000509355 OR4B1Q8NGF8 309 aa2.78□□□□□ -1.96
PDE4D-217ENST00000509355 OR5H2Q8NGV7 314 aa2.78□□□□□ -1.96
PDE4D-217ENST00000509355 OR5AK2Q8NH90 309 aa2.78□□□□□ -1.96
PDE4D-217ENST00000509355 BORCS7Q96B45 105 aa2.78□□□□□ -1.96
PDE4D-217ENST00000509355 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
PDE4D-217ENST00000509355 CCDC32Q9BV29 185 aa2.78□□□□□ -1.96
PDE4D-217ENST00000509355 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
PDE4D-217ENST00000509355 EFCAB1Q9HAE3 211 aa2.78□□□□□ -1.96
PDE4D-217ENST00000509355 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
PDE4D-217ENST00000509355 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa2.77□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 E7EUB6 86 aa2.77□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 G3V2T6 193 aa2.77□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 H3BMM0 161 aa2.77□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 J3QLW9 94 aa2.77□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF861PO60384 105 aa2.77□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 APCSP02743 223 aa2.77□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 NPPCP23582 126 aa2.77□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 PIGPP57054 158 aa2.77□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 SFXN4Q6P4A7 337 aa2.77□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa2.77□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 Q6ZRU5 148 aa2.77□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 ORMDL3Q8N138 153 aa2.77□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 C1orf158Q8N1D5 194 aa2.77□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 Q8N814 137 aa2.77□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 OR4X1Q8NH49 305 aa2.77□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 DIRAS2Q96HU8 199 aa2.77□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 DNAJC30Q96LL9 226 aa2.77□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 PDCD10Q9BUL8 212 aa2.77□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 WFDC1Q9HC57 220 aa2.77□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 SAR1AQ9NR31 198 aa2.77□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 A0A1B0GVX0 72 aa2.76□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM212A6NML5 194 aa2.76□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 OR4C45A6NMZ5 311 aa2.76□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 J3QRK9 145 aa2.76□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 M0R129 80 aa2.76□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 GNG7O60262 68 aa2.76□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 CTSGP08311 255 aa2.76□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 OR5G3P0C626 314 aa2.76□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 HLA-DRB3P79483 266 aa2.76□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 IFITM2Q01629 132 aa2.76□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 KLK9Q2XQG4 91 aa2.76□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 Q6ZSA8 131 aa2.76□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 C6orf201Q7Z4U5 140 aa2.76□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa2.76□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa2.76□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 Q8N976 141 aa2.76□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 OR51H1Q8NH63 302 aa2.76□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa2.76□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 DERL3Q96Q80 235 aa2.76□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 MARVELD1Q9BSK0 173 aa2.76□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 COMMD5Q9GZQ3 224 aa2.76□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 C8orf17Q9NRJ1 99 aa2.76□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 CKLFQ9UBR5 152 aa2.76□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 KLK9Q9UKQ9 250 aa2.76□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 LY96Q9Y6Y9 160 aa2.76□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 FAT3Q8TDW7 4589 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 A8MWL6 223 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 B4DEV8 164 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM250H0YL14 139 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 BPY2O14599 106 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 SOCS1O15524 211 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 CXorf1O96002 111 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 HRASP01112 189 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 SEC11BP0C7V7 166 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 HLA-DRB4P13762 266 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 EVI2AP22794 236 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 GABARAPL2P60520 117 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 CKS1BP61024 79 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 FABP5Q01469 135 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM241Q24JQ0 296 aa2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.7 ms