RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491581.5

HDAC3-211, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-211ENST00000491581 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 OR11H4Q8NGC9 324 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 BAALCQ8WXS3 180 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 GTSF1LQ9H1H1 148 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa5.88□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 FABP5P3A8MUU1 101 aa5.88□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 K7EQM0 130 aa5.88□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 MGST1P10620 155 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 TIRAPP58753 221 aa5.88□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 MYCBP2O75592 4640 aa5.87□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa5.87□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 SCO2A0A1W2PP80 73 aa5.87□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 PAGE4O60829 102 aa5.87□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 MBP02144 154 aa5.87□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 C1QBP02746 253 aa5.87□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa5.87□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa5.87□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 CST9LP1Q5W188 147 aa5.87□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa5.87□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 FRZBQ92765 325 aa5.87□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 C10orf126Q8N4M7 172 aa5.86□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 OR10AG1Q8NH19 301 aa5.86□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 PTH2Q96A98 100 aa5.86□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 BATF3Q9NR55 127 aa5.86□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 IL36BQ9NZH7 164 aa5.86□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 KLK12Q9UKR0 248 aa5.86□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 A8MWV9 139 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 LTAP01374 205 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 GZMBP10144 247 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 CCL20P78556 96 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF674Q2M3X9 581 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 SH2D6Q7Z4S9 175 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 NIT1Q86X76 327 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 FAM213BQ8TBF2 198 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 SFRP2Q96HF1 295 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 DERL1Q9BUN8 251 aa5.85□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 AKR1C3P42330 323 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 UBE2G1P62253 170 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 FAM162BQ5T6X4 162 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 PRR27Q6MZM9 219 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 CLPSL2Q6UWE3 100 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 ZFP2Q6ZN57 461 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 UBE2WQ96B02 151 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa5.84□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 RBFOX3A6NFN3 312 aa5.83□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 K7EP13 123 aa5.83□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 TPT1P13693 172 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 RGS21Q2M5E4 152 aa5.83□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 DNLZQ5SXM8 178 aa5.83□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 SCXQ7RTU7 201 aa5.83□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 Q8N976 141 aa5.83□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 SFT2D1Q8WV19 159 aa5.83□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 HIST1H2BAQ96A08 127 aa5.83□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 FMC1Q96HJ9 113 aa5.83□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM70Q9BUB7 260 aa5.83□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 UBE2D3P61077 147 aa5.82□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 UBE2D2P62837 147 aa5.82□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF56Q15929 161 aa5.82□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 MPV17L2Q567V2 206 aa5.82□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 ENHOQ6UWT2 76 aa5.82□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 Q6ZSA8 131 aa5.82□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa5.82□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 COX8CQ7Z4L0 72 aa5.82□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 KCNRGQ8N5I3 272 aa5.82□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 SYT8Q8NBV8 401 aa5.82□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa5.82□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 STOML3Q8TAV4 291 aa5.82□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 ZFP30Q9Y2G7 519 aa5.82□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 FAM229AH3BQW9 127 aa5.81□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 CIDEAO60543 219 aa5.81□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 LAGE3Q14657 143 aa5.81□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 C15orf54Q8N8G6 183 aa5.81□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 MBD3L1Q8WWY6 194 aa5.81□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 MLST8Q9BVC4 326 aa5.81□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 RAB19A4D1S5 217 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM262E9PQX1 116 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 PANO1I0J062 215 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 IGLV2-8P01709 118 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 BAGE2Q86Y30 109 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 ZFP82Q8N141 532 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 TM2D2Q9BX73 214 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.8□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 RHODO00212 210 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 BCL2L11O43521 198 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 HLA-DQA1P01909 254 aa5.79□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 RPL35P42766 123 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
HDAC3-211ENST00000491581 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
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